169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3521 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3521  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 139 aa  285  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.761017  normal  0.0424383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5863  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30.83 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  30.25 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  27.52 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1351  LysR, substrate-binding  34.67 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  33.66 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  28.1 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  28.35 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0276  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30.91 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  30.09 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  27.59 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  29.27 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  27.43 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  25.64 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 178 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  27.07 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  30 
 
 		 153 aa  50.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 167 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  25.19 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 263 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  30 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05222  thioesterase  33.77 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  30.59 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  27.16 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2078  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.571486  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  27.1 
 
 		 248 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1502  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0333721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  27.36 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1636  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 314 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  27.36 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  25.86 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.17 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 		 327 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0936  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  25.86 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 328 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  24.53 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>