154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0563 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0563  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0551  hypothetical protein  99.66 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0644  hypothetical protein  74.57 
 
 		 291 aa  472  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3563  hypothetical protein  35.69 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1203  protein of unknown function DUF519  34.81 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478331  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3858  hypothetical protein  35.71 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0788  hypothetical protein  37.04 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0241921  normal  0.12768 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2569  hypothetical protein  35.37 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1090  protein of unknown function DUF519  36.36 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0580192  hitchhiker  0.000491386 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1236  protein of unknown function DUF519  36.36 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  hitchhiker  0.0000201181 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0037  transformation competence-related protein  33.55 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.932971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04743  hypothetical protein  34.41 
 
 		 302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0705  hypothetical protein  34.65 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1938  hypothetical protein  37.41 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3648  hypothetical protein  33.56 
 
 		 279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1917  hypothetical protein  30.82 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0517  yhiR family protein  35.89 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.30636  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2736  hypothetical protein  34.84 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.855465  normal  0.779892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1970  hypothetical protein  35.51 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445046  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1019  hypothetical protein  36.64 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1564  hypothetical protein  37.05 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0696  hypothetical protein  33.99 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001953  hypothetical protein  36 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1180  hypothetical protein  36.19 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573551  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3738  hypothetical protein  32.53 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000524629 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2581  hypothetical protein  35 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.456932  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1284  hypothetical protein  36.94 
 
 		 285 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0121  hypothetical protein  33.9 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3205  hypothetical protein  30.19 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0027  protein of unknown function DUF519  36.12 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0764421  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0029  hypothetical protein  33.22 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0898  hypothetical protein  33.81 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.69089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0661  hypothetical protein  36.64 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3609  hypothetical protein  32.42 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00525  hypothetical protein  34.43 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2730  hypothetical protein  33.94 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0881  protein of unknown function DUF519  36.82 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0859  protein of unknown function DUF519  34.91 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4204  protein of unknown function DUF519  32.99 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4243  hypothetical protein  32.99 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4377  hypothetical protein  32.99 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0098  hypothetical protein  33.11 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3981  DNA utilization protein YhiR  32.19 
 
 		 280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4846  DNA utilization protein YhiR  32.19 
 
 		 280 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.780347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4659  hypothetical protein  33.11 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1258  hypothetical protein  34.81 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03348  predicted DNA (exogenous) processing protein  32.19 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.664942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2039  hypothetical protein  33.01 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03301  hypothetical protein  32.19 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.864633  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3823  DNA utilization protein YhiR  32.19 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3788  DNA utilization protein YhiR  32.19 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3242  protein of unknown function DUF519  32.62 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1107  hypothetical protein  33.67 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3566  protein of unknown function DUF519  32.62 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127057  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1259  hypothetical protein  34.44 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0216  protein of unknown function DUF519  31.85 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3970  DNA utilization protein YhiR  31.85 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3789  DNA utilization protein YhiR  31.85 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0217  hypothetical protein  31.85 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3699  DNA utilization protein YhiR  31.85 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3909  DNA utilization protein YhiR  31.85 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3801  DNA utilization protein YhiR  31.85 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3829  hypothetical protein  33.67 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.341276 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3922  hypothetical protein  33.67 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4038  hypothetical protein  33.45 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1365  protein of unknown function DUF519  36.4 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1483  hypothetical protein  37.45 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3867  DNA utilization protein YhiR  31.85 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4085  hypothetical protein  32.19 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.515626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66340  hypothetical protein  31.62 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4048  hypothetical protein  32.19 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0115  hypothetical protein  32.19 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.795354  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1888  hypothetical protein  33.21 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0163  hypothetical protein  34.07 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4050  hypothetical protein  33.21 
 
 		 280 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5756  hypothetical protein  32.45 
 
 		 278 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4945  hypothetical protein  33.83 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1053  hypothetical protein  33.09 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4817  hypothetical protein  33.83 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2528  hypothetical protein  34.21 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3158  putative protein involved in catabolism of external DNA  33.82 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1377  hypothetical protein  32.62 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0826832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0143  hypothetical protein  34.07 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3912  hypothetical protein  30.14 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0293  protein of unknown function DUF519  36.36 
 
 		 275 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4713  hypothetical protein  32.22 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1807  hypothetical protein  32.03 
 
 		 281 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0009  protein of unknown function DUF519  31.16 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3717  hypothetical protein  33.1 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3368  hypothetical protein  30.8 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0012  protein of unknown function DUF519  30.48 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3389  DNA (exogenous) processing protein  33.09 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1731  hypothetical protein  33.7 
 
 		 286 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0599  hypothetical protein  32.72 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.558917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1963  hypothetical protein  32.72 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0614068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2238  hypothetical protein  32.84 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4994  hypothetical protein  34.39 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45040  hypothetical protein  33.58 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1391  protein of unknown function DUF519  34.12 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443033  hitchhiker  0.00435595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0523  hypothetical protein  35.18 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0490056 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>