56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3259 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3259  TRAP-type uncharacterized transport system protein, periplasmic component  100 
 
 		 374 aa  774    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3359  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  34.18 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  hitchhiker  0.000000000800909 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3559  TRAP-type uncharacterized transport system protein, periplasmic component  33.42 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4887  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  33.43 
 
 		 358 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.393187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1781  hypothetical protein  35.2 
 
 		 357 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568147  unclonable  0.000000000964145 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3295  KDPG and KHG aldolase  29.48 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.808807 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4032  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.79 
 
 		 348 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0151449  normal  0.772934 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3299  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  29.48 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.783922  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1924  putative TRAP transporter solute receptor  28.53 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00617183  hitchhiker  0.0000000000275167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0245  TRAP-type uncharacterized transporter domain-containing protein  24.09 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3556  hypothetical protein  25.47 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.961167  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6523  TRAP-type uncharacterized transporter domain-containing protein  25.25 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1156  31 kDa immunogenic protein  34.29 
 
 		 316 aa  57  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1194  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.51 
 
 		 329 aa  55.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5576  hypothetical protein  23.24 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0817  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.69 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000102609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2429  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  31.1 
 
 		 329 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25673  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0082  immunogenic protein  30.25 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0148349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0528  hypothetical protein  22.73 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5709  hypothetical protein  25.5 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0224  hypothetical protein  22.44 
 
 		 367 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3808  hypothetical protein  22.44 
 
 		 367 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4101  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.27 
 
 		 317 aa  49.7  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0114  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.36 
 
 		 332 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1252  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.45 
 
 		 323 aa  49.7  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0137  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.07 
 
 		 350 aa  49.7  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2671  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.63 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.43 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.745912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0064  hypothetical protein  21.98 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.257348 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0394  putative immunogenic protein  27.45 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0147572  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4067  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.08 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.548232  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1764  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.31 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0645  immunogenic protein  28.12 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.208055  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3566  TRAP transporter solute receptor, TAXI family protein  30 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.28304  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0664  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.09 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0461  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.99 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4024  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.57 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4573  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  30 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3828  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  28.57 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3568  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.99 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3901  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.57 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0457  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3381  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  29.71 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0746  TRAP-T family transporter periplasmic substrate binding subunit  27.27 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.842378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0433  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.57 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0456  immunogenic-related protein  28.99 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0649  DNA primase  30.22 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0539  immunogenic protein  25.64 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0934  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.01 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1175  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.98 
 
 		 330 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155667  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0314  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  29.29 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.889469  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0267  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.09 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1890  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.59 
 
 		 333 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.966009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0741  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  27.27 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0608  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  23.13 
 
 		 326 aa  43.1  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.516133  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1613  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  26.09 
 
 		 317 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>