More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0218 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1308  AMP-dependent synthetase and ligase  62.61 
 
 		 633 aa  707    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.748569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0385  AMP-dependent synthetase and ligase  93.67 
 
 		 572 aa  1069    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0218  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 572 aa  1129    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493154 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1562  AMP-dependent synthetase and ligase  53.58 
 
 		 568 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  51.21 
 
 		 588 aa  548  1e-155  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.000292918  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  38.28 
 
 		 638 aa  348  1e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  36.71 
 
 		 666 aa  342  1e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  35.62 
 
 		 668 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  35.97 
 
 		 667 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  35.76 
 
 		 670 aa  325  2e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  35.68 
 
 		 656 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  34.57 
 
 		 666 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  35.74 
 
 		 666 aa  313  5.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  33.5 
 
 		 664 aa  311  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  34.42 
 
 		 632 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  35.36 
 
 		 649 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  34.42 
 
 		 631 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  33.68 
 
 		 638 aa  310  6.999999999999999e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  34.25 
 
 		 632 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  33.85 
 
 		 667 aa  309  9e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 652 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  34.83 
 
 		 639 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  32.99 
 
 		 666 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  34.02 
 
 		 667 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  34.54 
 
 		 631 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  34.27 
 
 		 664 aa  306  9.000000000000001e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  33.78 
 
 		 650 aa  306  9.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  33.5 
 
 		 657 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  32.99 
 
 		 663 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  33.61 
 
 		 650 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  34.13 
 
 		 667 aa  301  3e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 		 661 aa  300  4e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  35.85 
 
 		 660 aa  300  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  35.04 
 
 		 652 aa  300  4e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  35.04 
 
 		 652 aa  300  5e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  34.82 
 
 		 625 aa  299  7e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  35.25 
 
 		 643 aa  299  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  38.11 
 
 		 651 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  35.25 
 
 		 629 aa  299  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  34.87 
 
 		 629 aa  298  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  34.24 
 
 		 649 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  33.95 
 
 		 636 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  34.29 
 
 		 639 aa  297  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  33.61 
 
 		 636 aa  297  4e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  34.25 
 
 		 653 aa  296  6e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  34.02 
 
 		 652 aa  296  8e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  33.78 
 
 		 636 aa  296  9e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  35.13 
 
 		 660 aa  296  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  34.47 
 
 		 661 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  36.38 
 
 		 656 aa  295  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  37.56 
 
 		 654 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2222  acetate--CoA ligase  38.31 
 
 		 648 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  34.36 
 
 		 652 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  35.92 
 
 		 667 aa  294  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  34.99 
 
 		 655 aa  294  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  36.16 
 
 		 674 aa  293  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  35.67 
 
 		 715 aa  293  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  33.78 
 
 		 649 aa  292  9e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  35.45 
 
 		 661 aa  292  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  35.91 
 
 		 670 aa  292  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  33.89 
 
 		 657 aa  290  6e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  34.5 
 
 		 648 aa  289  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5331  acetate/CoA ligase  35.7 
 
 		 656 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.151979 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  34.58 
 
 		 644 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  33.33 
 
 		 652 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  34.51 
 
 		 658 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  32.95 
 
 		 661 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  35.08 
 
 		 680 aa  287  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  34.92 
 
 		 648 aa  286  5e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  35.74 
 
 		 629 aa  287  5e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  35.32 
 
 		 658 aa  286  7e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1099  acetate/CoA ligase  35.53 
 
 		 700 aa  286  7e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  34.3 
 
 		 631 aa  286  8e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  33.78 
 
 		 654 aa  286  9e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3916  acetate/CoA ligase  33.39 
 
 		 648 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  34.48 
 
 		 676 aa  286  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33450  acetyl-coenzyme A synthetase  36.49 
 
 		 662 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0726  acetate/CoA ligase  33.22 
 
 		 655 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  34.97 
 
 		 670 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  34.58 
 
 		 651 aa  284  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  35.68 
 
 		 629 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  33.56 
 
 		 650 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  36.85 
 
 		 659 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3169  acetate/CoA ligase  36.36 
 
 		 662 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  36.29 
 
 		 661 aa  283  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  34.63 
 
 		 632 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  35.17 
 
 		 661 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  35.84 
 
 		 653 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  35.31 
 
 		 659 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  36.14 
 
 		 659 aa  282  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  33.77 
 
 		 657 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  33.97 
 
 		 655 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  32.88 
 
 		 658 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  33.16 
 
 		 644 aa  280  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5594  acetate/CoA ligase  34.89 
 
 		 658 aa  280  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01080  acetyl-coenzyme A synthetase  36.23 
 
 		 650 aa  279  9e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  33.95 
 
 		 655 aa  279  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  34.88 
 
 		 660 aa  278  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 652 aa  278  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  34.89 
 
 		 657 aa  276  5e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>