More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1611 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
588 aa  1156    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.000292918  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1308  AMP-dependent synthetase and ligase  47.97 
 
 
633 aa  561  1e-158  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.748569  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0218  AMP-dependent synthetase and ligase  51.21 
 
 
572 aa  548  1e-154  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493154 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0385  AMP-dependent synthetase and ligase  50.17 
 
 
572 aa  530  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1562  AMP-dependent synthetase and ligase  43.15 
 
 
568 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  34.44 
 
 
638 aa  311  2e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  33.83 
 
 
649 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  34.86 
 
 
667 aa  306  6e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  34.88 
 
 
666 aa  300  4e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  32.56 
 
 
655 aa  297  3e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  34.83 
 
 
668 aa  295  1e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  32.24 
 
 
652 aa  294  3e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  32.77 
 
 
652 aa  291  3e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  35.21 
 
 
670 aa  290  4e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  32.77 
 
 
652 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  33.72 
 
 
666 aa  289  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  31.03 
 
 
649 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  32.6 
 
 
652 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  30.58 
 
 
666 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  31.67 
 
 
649 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  31.52 
 
 
666 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  31.34 
 
 
664 aa  283  7.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  32.4 
 
 
651 aa  281  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  32.62 
 
 
648 aa  281  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  31.07 
 
 
667 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  31.96 
 
 
656 aa  280  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  31.25 
 
 
652 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  30.25 
 
 
657 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  30.71 
 
 
643 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  31.4 
 
 
639 aa  276  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  29.92 
 
 
667 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  29.56 
 
 
664 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  30.63 
 
 
660 aa  273  6e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  32.75 
 
 
656 aa  272  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  30.08 
 
 
667 aa  272  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  31.39 
 
 
632 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  30.62 
 
 
631 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  31.22 
 
 
632 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  30.52 
 
 
636 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  31.22 
 
 
631 aa  270  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  29.27 
 
 
638 aa  269  8e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  31.09 
 
 
649 aa  269  8.999999999999999e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 
652 aa  269  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  31.03 
 
 
636 aa  269  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 
661 aa  267  5e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  29.93 
 
 
650 aa  266  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  29.39 
 
 
663 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  30.98 
 
 
661 aa  264  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  30.65 
 
 
632 aa  264  3e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  31.75 
 
 
661 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  30.98 
 
 
639 aa  264  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  30.35 
 
 
636 aa  264  4e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  33.71 
 
 
674 aa  263  4.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  31.9 
 
 
692 aa  263  8e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  28.83 
 
 
626 aa  262  1e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  31.05 
 
 
655 aa  262  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  31.05 
 
 
655 aa  262  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  30.77 
 
 
650 aa  261  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  30.79 
 
 
657 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  31.37 
 
 
658 aa  259  6e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  32.2 
 
 
658 aa  259  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  29.6 
 
 
650 aa  259  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  31.32 
 
 
667 aa  259  9e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  30.6 
 
 
629 aa  258  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  29.8 
 
 
656 aa  258  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  30.48 
 
 
657 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  30.13 
 
 
655 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  31.17 
 
 
660 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  34.01 
 
 
654 aa  256  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  30.9 
 
 
670 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  29.73 
 
 
648 aa  254  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  30.08 
 
 
657 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  29.8 
 
 
655 aa  254  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  31.66 
 
 
673 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  27.78 
 
 
653 aa  253  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  31.01 
 
 
656 aa  253  6e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  31.94 
 
 
715 aa  253  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  29.84 
 
 
661 aa  253  7e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  31 
 
 
648 aa  252  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  30.53 
 
 
632 aa  252  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  29.38 
 
 
657 aa  252  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  30.1 
 
 
660 aa  253  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0611  acetate/CoA ligase  33.01 
 
 
667 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  31.72 
 
 
680 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2222  acetate--CoA ligase  33.21 
 
 
648 aa  252  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  31.73 
 
 
629 aa  252  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  31.97 
 
 
651 aa  252  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  31.48 
 
 
651 aa  251  3e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  30.66 
 
 
629 aa  251  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  32.26 
 
 
661 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  30.93 
 
 
656 aa  251  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  30.98 
 
 
659 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  30.1 
 
 
660 aa  250  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  29.77 
 
 
664 aa  250  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  30.58 
 
 
664 aa  250  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.11302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  29.31 
 
 
629 aa  249  8e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  29.06 
 
 
657 aa  249  9e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  30.16 
 
 
657 aa  249  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  29.27 
 
 
664 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  29.42 
 
 
657 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>