More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1308 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1308  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
633 aa  1274    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.748569  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0385  AMP-dependent synthetase and ligase  62.33 
 
 
572 aa  715    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0218  AMP-dependent synthetase and ligase  62.61 
 
 
572 aa  721    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.493154 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  48.14 
 
 
588 aa  568  1e-161  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.000292918  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1562  AMP-dependent synthetase and ligase  50.94 
 
 
568 aa  550  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  38.04 
 
 
638 aa  387  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  36.46 
 
 
666 aa  383  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  36.31 
 
 
666 aa  370  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  36.87 
 
 
667 aa  370  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  34.8 
 
 
656 aa  357  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  36.2 
 
 
668 aa  356  6.999999999999999e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  35.56 
 
 
670 aa  348  2e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  35.01 
 
 
660 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  34.11 
 
 
652 aa  343  5.999999999999999e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  34.11 
 
 
652 aa  343  8e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  34.28 
 
 
652 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  34.44 
 
 
661 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  33.82 
 
 
655 aa  336  5.999999999999999e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  33.98 
 
 
636 aa  335  1e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  35.44 
 
 
629 aa  335  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  33.5 
 
 
631 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  33.82 
 
 
636 aa  335  2e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  33.67 
 
 
632 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  33.93 
 
 
664 aa  333  4e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  33.5 
 
 
632 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  33.33 
 
 
636 aa  332  9e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  33.18 
 
 
666 aa  332  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  33.72 
 
 
631 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  34.63 
 
 
629 aa  330  6e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  32.69 
 
 
643 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  35.21 
 
 
670 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4118  acetate/CoA ligase  32.61 
 
 
652 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  34.88 
 
 
656 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  33.39 
 
 
644 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  32.97 
 
 
626 aa  325  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  33.23 
 
 
648 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 
661 aa  322  9.999999999999999e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  34.37 
 
 
632 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  31.93 
 
 
650 aa  321  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  32.71 
 
 
638 aa  321  3e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 
652 aa  319  7.999999999999999e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0266895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  33.97 
 
 
660 aa  319  7.999999999999999e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  32.1 
 
 
650 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  34.93 
 
 
632 aa  318  3e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  34.27 
 
 
674 aa  318  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  35.24 
 
 
629 aa  316  6e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  32.69 
 
 
657 aa  316  7e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  32.81 
 
 
625 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  32.52 
 
 
660 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  33.76 
 
 
629 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  33.11 
 
 
639 aa  315  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  32.03 
 
 
649 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  33.12 
 
 
649 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  32.41 
 
 
715 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  34.76 
 
 
659 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  32.85 
 
 
658 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1099  acetate/CoA ligase  33.55 
 
 
700 aa  312  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  32.1 
 
 
661 aa  312  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  33.01 
 
 
651 aa  312  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  32.54 
 
 
657 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  33.64 
 
 
661 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  32.36 
 
 
639 aa  310  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  32.25 
 
 
657 aa  309  9e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  33.59 
 
 
655 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  31.77 
 
 
649 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  31.88 
 
 
649 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  29.31 
 
 
666 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  33.23 
 
 
655 aa  308  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  33.18 
 
 
635 aa  307  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  32.46 
 
 
655 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  32.46 
 
 
655 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  33.94 
 
 
676 aa  306  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  35 
 
 
651 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  32.59 
 
 
664 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  32.97 
 
 
680 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12630  acetyl-coenzyme A synthetase  34 
 
 
658 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.406293  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  28.98 
 
 
664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  32.59 
 
 
664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  32.61 
 
 
644 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  29 
 
 
667 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  32.79 
 
 
654 aa  303  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  32.36 
 
 
652 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  33.18 
 
 
655 aa  303  8.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  32.56 
 
 
663 aa  303  9e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  32.65 
 
 
661 aa  303  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  33.5 
 
 
631 aa  302  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0976  acetate/CoA ligase  33.28 
 
 
659 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  31.48 
 
 
653 aa  302  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  34.91 
 
 
631 aa  302  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  32.52 
 
 
660 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  34.05 
 
 
656 aa  302  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  32.39 
 
 
670 aa  302  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  29.61 
 
 
657 aa  302  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2222  acetate--CoA ligase  36.08 
 
 
648 aa  302  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  32.52 
 
 
660 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  33.28 
 
 
659 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  33.11 
 
 
661 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1846  acetyl-CoA synthetase  32.78 
 
 
692 aa  301  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4841  acetate/CoA ligase  33.85 
 
 
653 aa  301  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  33.66 
 
 
658 aa  301  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>