More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3589 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3589  flagellin domain-containing protein  100 
 
 
341 aa  668    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3588  flagellin domain-containing protein  72.59 
 
 
392 aa  511  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3587  flagellin domain-containing protein  81.16 
 
 
345 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  49.41 
 
 
289 aa  295  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  44.22 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  63.89 
 
 
281 aa  225  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4651  flagellin domain-containing protein  40.97 
 
 
303 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708723  normal  0.498998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3957  flagellin domain-containing protein  42.01 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  38.65 
 
 
393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  38.56 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0057  flagellin domain-containing protein  39.82 
 
 
264 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  36.86 
 
 
384 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  36.62 
 
 
379 aa  206  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  37.21 
 
 
377 aa  199  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  36.72 
 
 
377 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3956  flagellin domain-containing protein  40.88 
 
 
272 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  37.56 
 
 
377 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  36.72 
 
 
377 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  40.64 
 
 
280 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0199  flagellin  36.84 
 
 
296 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0151  flagellin D  36.55 
 
 
296 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979093  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3358  flagellin domain-containing protein  39.27 
 
 
304 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0276  lateral flagellar flagellin LafA  39.27 
 
 
304 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0420312  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  36.39 
 
 
378 aa  192  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3456  flagellin domain-containing protein  39.35 
 
 
267 aa  192  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  35.66 
 
 
376 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  36.27 
 
 
379 aa  192  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  39.18 
 
 
276 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  38.12 
 
 
273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  35.6 
 
 
376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3455  flagellin domain-containing protein  39.82 
 
 
270 aa  190  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  38.53 
 
 
271 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  38.53 
 
 
271 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  34.38 
 
 
375 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  35.84 
 
 
402 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  36.13 
 
 
377 aa  186  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  36.95 
 
 
275 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  39.12 
 
 
272 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  36.95 
 
 
275 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  37.24 
 
 
273 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  38.01 
 
 
272 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  38.01 
 
 
272 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  35.88 
 
 
272 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  35.53 
 
 
319 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  35.92 
 
 
319 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  36.18 
 
 
272 aa  176  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  35.38 
 
 
294 aa  175  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3639  flagellin-like protein  37.57 
 
 
266 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  35.78 
 
 
273 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  36.18 
 
 
272 aa  169  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  35.26 
 
 
380 aa  169  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  35.2 
 
 
375 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  47.06 
 
 
484 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  34.59 
 
 
294 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  35.46 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  32.75 
 
 
392 aa  165  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  33.25 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  35.78 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  46.61 
 
 
485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  32.91 
 
 
387 aa  162  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  35.59 
 
 
274 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  34.02 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  34.6 
 
 
283 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  46.79 
 
 
516 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  37.39 
 
 
287 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  36.26 
 
 
295 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  33.33 
 
 
405 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  34.71 
 
 
274 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  33.14 
 
 
279 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  46.12 
 
 
488 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  34.87 
 
 
390 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  33.53 
 
 
278 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  35.04 
 
 
388 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  32.94 
 
 
276 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  33.72 
 
 
274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  51.79 
 
 
377 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  51.81 
 
 
467 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3959  flagellin domain-containing protein  50.3 
 
 
270 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  52.41 
 
 
387 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  33.54 
 
 
282 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  30.13 
 
 
387 aa  152  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  35.57 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  34.41 
 
 
293 aa  152  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  32.57 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  36.34 
 
 
327 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
481 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  34.31 
 
 
272 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3958  flagellin domain-containing protein  49.38 
 
 
268 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  33.07 
 
 
386 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  37.35 
 
 
288 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  33.24 
 
 
356 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  32.05 
 
 
379 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  32.66 
 
 
389 aa  150  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  34.12 
 
 
287 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  35.09 
 
 
290 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  34.76 
 
 
281 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  44.95 
 
 
517 aa  149  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  34.96 
 
 
304 aa  149  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  51.22 
 
 
468 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  34.71 
 
 
271 aa  149  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>