More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3639 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3639  flagellin-like protein  100 
 
 
266 aa  521  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3958  flagellin domain-containing protein  78.36 
 
 
268 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3456  flagellin domain-containing protein  78.44 
 
 
267 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3957  flagellin domain-containing protein  76.95 
 
 
267 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3956  flagellin domain-containing protein  74.26 
 
 
272 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3455  flagellin domain-containing protein  75 
 
 
270 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0057  flagellin domain-containing protein  73.21 
 
 
264 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3959  flagellin domain-containing protein  72.69 
 
 
270 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0063  flagellin domain-containing protein  62.73 
 
 
272 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  51.92 
 
 
289 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  50.18 
 
 
281 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  45.64 
 
 
299 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0199  flagellin  41.22 
 
 
296 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161048  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  43.48 
 
 
279 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  43.53 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0151  flagellin D  41.22 
 
 
296 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  43.38 
 
 
276 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  42.75 
 
 
279 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4651  flagellin domain-containing protein  40.98 
 
 
303 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708723  normal  0.498998 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3358  flagellin domain-containing protein  42.91 
 
 
304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0276  lateral flagellar flagellin LafA  42.91 
 
 
304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0420312  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  44.77 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  40.81 
 
 
272 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  39.78 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  39.78 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  40.44 
 
 
273 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  41.11 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  41.7 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  39.78 
 
 
271 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  39.78 
 
 
271 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  40.74 
 
 
273 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  39.03 
 
 
272 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  41.11 
 
 
273 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  41.99 
 
 
283 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  39.03 
 
 
272 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  42.8 
 
 
271 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  41.76 
 
 
273 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  39.34 
 
 
275 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  39.34 
 
 
275 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  43.21 
 
 
285 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  40.56 
 
 
286 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  38.66 
 
 
271 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  38.66 
 
 
271 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  40.37 
 
 
272 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  40.22 
 
 
273 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  42.44 
 
 
271 aa  176  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  42.44 
 
 
271 aa  175  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  42.51 
 
 
290 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  40 
 
 
272 aa  175  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  41.48 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  41.48 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  41.79 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  40.37 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  38.83 
 
 
294 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  42.09 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  42.28 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  39.34 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  38.78 
 
 
294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  41.54 
 
 
271 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  41.94 
 
 
278 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  39.48 
 
 
272 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  39.34 
 
 
273 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  38.52 
 
 
273 aa  168  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  42.36 
 
 
288 aa  168  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  43.72 
 
 
273 aa  168  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  39.78 
 
 
276 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  38.97 
 
 
274 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  38.6 
 
 
274 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  37.82 
 
 
275 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  39.71 
 
 
274 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  40.07 
 
 
271 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  38.11 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  39.78 
 
 
271 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  38.97 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  40.31 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  41.67 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1283  flagellin domain-containing protein  39.93 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  38.52 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  38.15 
 
 
272 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  40.88 
 
 
314 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  38.49 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  41.28 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  41.42 
 
 
281 aa  162  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  39.15 
 
 
283 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  41.04 
 
 
281 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  36.88 
 
 
319 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3588  flagellin domain-containing protein  46.27 
 
 
392 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1583  flagellin domain-containing protein  38.85 
 
 
278 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260385  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  38.49 
 
 
275 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  40 
 
 
282 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  39.64 
 
 
282 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  38.35 
 
 
265 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  40.38 
 
 
272 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  38.58 
 
 
266 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  42.09 
 
 
278 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  36.6 
 
 
262 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  38.38 
 
 
287 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  35.74 
 
 
319 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1581  flagellin domain-containing protein  38.08 
 
 
280 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  40.29 
 
 
272 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>