More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0057 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0057  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  511  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3456  flagellin domain-containing protein  78.57 
 
 		 267 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3957  flagellin domain-containing protein  77.82 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0063  flagellin domain-containing protein  74.63 
 
 		 272 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3455  flagellin domain-containing protein  75.46 
 
 		 270 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3956  flagellin domain-containing protein  73.8 
 
 		 272 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3958  flagellin domain-containing protein  74.53 
 
 		 268 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3639  flagellin-like protein  73.21 
 
 		 266 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3959  flagellin domain-containing protein  72.49 
 
 		 270 aa  361  8e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  52.88 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  50.35 
 
 		 289 aa  245  6.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  47.47 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  45.99 
 
 		 276 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0199  flagellin  42.76 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0151  flagellin D  44.07 
 
 		 296 aa  198  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979093  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4651  flagellin domain-containing protein  41.39 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708723  normal  0.498998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  43.33 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  43.33 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  47.67 
 
 		 280 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  46.32 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  45.96 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  44.07 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  45.96 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  44.32 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  45.09 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  44.28 
 
 		 273 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3358  flagellin domain-containing protein  41.87 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0276  lateral flagellar flagellin LafA  41.87 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0420312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  42.44 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  43.57 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  43.17 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  41.3 
 
 		 294 aa  188  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  43.33 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  43.7 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  44.12 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  42.59 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  42.75 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  42.75 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  42.86 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  45.02 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  43.64 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  43.85 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  41.39 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  41.39 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  43.17 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  43.32 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  42.96 
 
 		 272 aa  184  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  43.54 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  40.89 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  44.65 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  40.89 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  42.01 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  43.51 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  42.01 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  43.38 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  39.73 
 
 		 294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  44.35 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  43.54 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  43.54 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  40.81 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  42.49 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  43.26 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  43.54 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  43.72 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  40.94 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  43.24 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  43.51 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  42.86 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  41.6 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  42.65 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  40.88 
 
 		 271 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  41.9 
 
 		 285 aa  178  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  40.94 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  44.32 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  42.49 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  42.75 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  42.05 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  40.46 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  41.64 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  43.73 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  39.77 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  41.97 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  40.7 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  42.49 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  43.01 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0315  flagellin domain-containing protein  40.39 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  41.31 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  40.15 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  42.44 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  41.16 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  38.49 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1284  flagellin domain-containing protein  41.88 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  39.39 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1581  flagellin domain-containing protein  38.71 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  40.94 
 
 		 276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  38.06 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  37.78 
 
 		 271 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  41.11 
 
 		 288 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  37.4 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1283  flagellin domain-containing protein  39.93 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>