More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0276 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0276  lateral flagellar flagellin LafA  100 
 
 
304 aa  585  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0420312  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3358  flagellin domain-containing protein  100 
 
 
304 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  47.02 
 
 
299 aa  258  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4651  flagellin domain-containing protein  45.31 
 
 
303 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708723  normal  0.498998 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0151  flagellin D  45.25 
 
 
296 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0199  flagellin  43.09 
 
 
296 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3956  flagellin domain-containing protein  41.78 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  42.39 
 
 
289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3456  flagellin domain-containing protein  42.76 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3958  flagellin domain-containing protein  42.11 
 
 
268 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3455  flagellin domain-containing protein  42.76 
 
 
270 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3957  flagellin domain-containing protein  42.11 
 
 
267 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0057  flagellin domain-containing protein  41.58 
 
 
264 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3639  flagellin-like protein  42.11 
 
 
266 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  40.59 
 
 
281 aa  205  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3587  flagellin domain-containing protein  37.43 
 
 
345 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3589  flagellin domain-containing protein  37.68 
 
 
341 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3959  flagellin domain-containing protein  41.5 
 
 
270 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0063  flagellin domain-containing protein  41.45 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  37.75 
 
 
272 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  35.86 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  36.75 
 
 
273 aa  162  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  36.51 
 
 
279 aa  162  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  36.42 
 
 
273 aa  162  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  37.09 
 
 
272 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  36.42 
 
 
271 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  38.49 
 
 
280 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  36.75 
 
 
270 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  36.75 
 
 
275 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  37.42 
 
 
271 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  36.75 
 
 
273 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  37.42 
 
 
271 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  35.76 
 
 
272 aa  159  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  36.75 
 
 
275 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  37.09 
 
 
273 aa  159  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  34.75 
 
 
278 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  37.83 
 
 
273 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  34.65 
 
 
279 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  37.1 
 
 
294 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1583  flagellin domain-containing protein  35.64 
 
 
278 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  34.55 
 
 
273 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3588  flagellin domain-containing protein  45.7 
 
 
392 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  35.76 
 
 
287 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1582  flagellin domain-containing protein  36.04 
 
 
281 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1581  flagellin domain-containing protein  35.97 
 
 
280 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  37.01 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  35.16 
 
 
294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  35.62 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  35.1 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  35.43 
 
 
273 aa  153  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  34.31 
 
 
276 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  34.44 
 
 
272 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  35.43 
 
 
274 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  35.43 
 
 
274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  36.09 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  36.09 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  36.63 
 
 
271 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  36.63 
 
 
271 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  35.43 
 
 
272 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  37.17 
 
 
288 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  35.76 
 
 
286 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  30.77 
 
 
379 aa  149  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  34.77 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  34.87 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  34.87 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  34.77 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  30.55 
 
 
384 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  34.88 
 
 
271 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  33.77 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  34.38 
 
 
287 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1283  flagellin domain-containing protein  33.99 
 
 
273 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  34.65 
 
 
271 aa  143  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2361  flagellin-like  33.84 
 
 
327 aa  143  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  36.3 
 
 
281 aa  143  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1547  flagellin  31.54 
 
 
367 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000229221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3618  flagellin  33.33 
 
 
283 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000440531  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  34.21 
 
 
271 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  33.55 
 
 
314 aa  142  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  29.07 
 
 
377 aa  142  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  34.31 
 
 
278 aa  142  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  35.97 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  33.88 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  33 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1284  flagellin domain-containing protein  34.64 
 
 
273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  33.55 
 
 
271 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  33.55 
 
 
271 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  36.36 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  32.33 
 
 
282 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  35.95 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  31.91 
 
 
319 aa  139  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  29.6 
 
 
377 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 
271 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1582  flagellin  34.2 
 
 
287 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000267264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1706  flagellin  34.2 
 
 
287 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0636682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  33 
 
 
282 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0071  flagellin domain-containing protein  33.44 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0550639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  30.49 
 
 
319 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  30.69 
 
 
275 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  34.75 
 
 
283 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1709  flagellin  34.09 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00621943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>