73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0648 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0648  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  100 
 
 		 345 aa  709    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3172  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  45.09 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00138054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3087  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  43.96 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160898 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  41.2 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1303  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  33.01 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.31563  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3131  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.3 
 
 		 348 aa  132  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.722243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0661  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.78 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00759751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3024  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.46 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1480  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.27 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0992802  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0303  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.13 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160879  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3497  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.75 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0438389  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2121  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536453  normal  0.433175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0512  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.09 
 
 		 326 aa  99.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0709  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.34 
 
 		 343 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2570  twin-arginine translocation pathway signal  25.37 
 
 		 363 aa  96.3  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7098  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  24.06 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0634  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 340 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0276  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.87 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.482161  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2216  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 333 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.36837  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0911  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.75 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0854  TRAP family periplasmic substrate binding subunit  25.08 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.347802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1708  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.55 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0309  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.75 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00849188  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0116  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.93 
 
 		 350 aa  89.7  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3023  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.03 
 
 		 344 aa  89.4  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0050  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.47 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.199103  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0280  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.65 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0400579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3675  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.3 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2003  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.6 
 
 		 356 aa  86.7  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00153551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2489  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.7 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3913  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2456  Extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2261  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.63 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.282279  normal  0.056564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2055  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.923985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0331  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3772  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.17 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1965  TRAP-T family transporter periplasmic substrate binding subunit  24.25 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155377  hitchhiker  0.00893261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3790  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.17 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1333  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.26 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1885  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.76 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29304  normal  0.241672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0332  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.43 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3582  TRAP dicarboxylate transporter DctP subunit  22.11 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0176642  normal  0.290109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0609  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.75 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1984  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  20.83 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0306  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.83 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.141674  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5036  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  21.93 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2289  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.06 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  0.280505 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0636  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  22.06 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0391566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2485  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.79 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0992841  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4203  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.93 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3540  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.95 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151055  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0870  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.6 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3209  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.08 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.586905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2784  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.21 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0226757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0932  ribosomal protein L22  21.86 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00199483  hitchhiker  0.00633944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2874  twin-arginine translocation pathway signal  38.57 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1732  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.11 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1039  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.14 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0821806 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3571  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  25.2 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.303866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0957  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.14 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.861985  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1502  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.14 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1815  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.26 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1613  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.8 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000374954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0645  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  32.43 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.183136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2184  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.65 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3285  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.28 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2032  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.15 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1438  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  27.35 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.597094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1572  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.24 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2243  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  35.71 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273001  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2411  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  29.66 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0721  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.86 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3219  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  21.41 
 
 		 333 aa  42.7  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>