79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0870 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0870  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  100 
 
 		 351 aa  705    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2035  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like  43.59 
 
 		 351 aa  294  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4203  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  38.79 
 
 		 350 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2904  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  34.87 
 
 		 362 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.963259  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2935  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  34.43 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2943  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.69 
 
 		 358 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000177028  decreased coverage  0.0000105865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0609  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  31.34 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5036  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.41 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2184  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.28 
 
 		 385 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3540  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.77 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151055  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2993  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.57 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00571621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3398  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  29.76 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0634  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2829  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.33 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1483  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  28.38 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0475923  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5228  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  30.64 
 
 		 346 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0331  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3264  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  29.44 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0646226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0648  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.6 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1475  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component  25.12 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2055  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.923985  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2750  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  31.33 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000216568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0557  Extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 324 aa  50.4  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2044  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.53 
 
 		 327 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3153  TRAP transporter - DctP subunit  28.91 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1824  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  27.33 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000127835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2659  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  26.09 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2289  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.86 
 
 		 374 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  0.280505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2003  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.97 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00153551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2456  Extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0243  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  27.52 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.883791 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3131  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.69 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.722243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0512  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.41 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0034  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.83 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0597  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  26.86 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135069  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0611  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  26.86 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000692559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3678  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.35 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1747  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  23.38 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2216  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.36837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2569  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  26.85 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.282286  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0910  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  26.85 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0354  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.71 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175887  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0636  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  24.03 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0391566  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3497  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.94 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0438389  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6043  TRAP-Type C4-dicarboxylate transport system, binding periplasmic protein (DctP subunit)  24.42 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2784  twin-arginine translocation pathway signal  25.35 
 
 		 344 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.968242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5944  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  27.43 
 
 		 340 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0162589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1941  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.53 
 
 		 355 aa  46.2  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1067  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  23.42 
 
 		 356 aa  46.2  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3258  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.04 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.0638334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004050  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system component  26.32 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4546  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.26 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1609  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.74 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2784  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  25.47 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7098  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  22.32 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1576  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  27.45 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1708  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.68 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0280  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.4 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0400579  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3481  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  27.16 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0875389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0618  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.79 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.81828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03650  TRAP dicarboxylate transporter-periplasmic solute receptor subunit; DctP  26.14 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0539672  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3681  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  26.75 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126879  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1438  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  28.57 
 
 		 338 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.597094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0332  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.59 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3234  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  26.85 
 
 		 332 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1333  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.28 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3172  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.37 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00138054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3043  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.72 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0570  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.83 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2320  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  24.23 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0994  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.23 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0709  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.79 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3880  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.97 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68260  c4-dicarboxylate-binding protein  24.47 
 
 		 331 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.298886  normal  0.12904 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3220  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.84 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00317601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5906  c4-dicarboxylate-binding protein  24.47 
 
 		 331 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3023  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.92 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15200  hypothetical protein  32.52 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0628298  hitchhiker  0.000000122837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2293  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  29.73 
 
 		 338 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.528549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>