46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2035 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2035  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like  100 
 
 		 351 aa  710    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  0.097204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0870  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  44.64 
 
 		 351 aa  292  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4203  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.91 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2935  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  37.46 
 
 		 360 aa  208  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2904  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  33.43 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.963259  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2943  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  33.04 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000177028  decreased coverage  0.0000105865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0422  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  30.5 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0386789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0034  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.95 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3258  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.55 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.0638334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2659  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.1 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0611  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.79 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000692559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0597  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.79 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2993  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.74 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00571621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1576  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  23.6 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0609  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.27 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3481  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.16 
 
 		 343 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0875389  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3258  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  32.19 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.478184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3540  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.13 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151055  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1187  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  25.99 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0246361  normal  0.126569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1824  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  22.89 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000127835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3087  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  33.33 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160898 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0910  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  26.4 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2569  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  26.4 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.282286  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0243  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  25.4 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.883791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1169  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  25.55 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3678  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.5 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2216  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.36837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2289  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.83 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  0.280505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3214  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  27.56 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4242  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  25.11 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2184  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.72 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1164  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.9 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3497  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.67 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0438389  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3220  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  24.58 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00317601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0636  TRAP dicarboxylate family transporter DctP subunit  23.83 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0391566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1203  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  24.67 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3153  TRAP transporter - DctP subunit  28.44 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2784  twin-arginine translocation pathway signal  23.99 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.968242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5036  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  22.89 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2485  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.25 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0992841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3172  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  26.42 
 
 		 340 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00138054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2261  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  23.74 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.282279  normal  0.056564 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2558  TRAP dicarboxylate transporter subunit DctP  25.77 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000108386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3301  TRAP dicarboxylate transporter, DctP subunit  29.22 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  30.57 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2931  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  25.2 
 
 		 351 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>