170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0327 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0327  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 339 aa  701    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2604  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  55.69 
 
 		 345 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0012  glycosyl transferase family protein  46.43 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0568378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3928  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase III  34.11 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3693  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase III  34.11 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0585  heptosyltransferase-like protein  33.97 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000371878  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0263  glycosyl transferase family 9  34.94 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.951367  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2559  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.3 
 
 		 779 aa  73.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  25.4 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  24.47 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.19 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.97 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  23.6 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.19 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.02 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  23.76 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.61 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  20.92 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.13 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.82 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.68 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.13 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.08 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  22.06 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  21.85 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.34 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2415  glycosyl transferase family 9  24.48 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0888849  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.23 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0682  hypothetical protein  24.69 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.28 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.62 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.57 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5206  glycosyl transferase family 9  22.73 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.58 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  21.85 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.34 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.34 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.34 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.38 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  22.88 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.62 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.62 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  22.92 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.34 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  22.34 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.56 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  23.57 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.34 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.34 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.34 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  21.65 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2876  hypothetical protein  23.99 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3929  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.61 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.34 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.61 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  20.45 
 
 		 400 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.61 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3478  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.36 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.3 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.61 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4097  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.61 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  21.02 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  22.07 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  22.82 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.75 
 
 		 361 aa  52.8  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  20.28 
 
 		 372 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.63 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  24.24 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.33 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.03 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.22 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.56 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.96 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.64 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  21.8 
 
 		 403 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 		 401 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  21.96 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.85 
 
 		 367 aa  49.7  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 344 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  20.4 
 
 		 356 aa  49.7  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  21.47 
 
 		 344 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  20.4 
 
 		 356 aa  49.7  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1612  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.51 
 
 		 346 aa  49.7  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 347 aa  49.7  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  21.88 
 
 		 368 aa  49.7  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0159  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.33 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  21.82 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.27 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  22.62 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.5 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>