More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2559 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2559  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 343 aa  711    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  24.86 
 
 		 361 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.64 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.37 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.36 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0327  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2604  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.71 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00142989  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  23.33 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  23.33 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.5 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21.07 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  23.65 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.29 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.57 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  24.86 
 
 		 779 aa  73.2  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0012  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0568378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.71 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  24 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  22.29 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  25.41 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.47 
 
 		 516 aa  69.7  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  23.37 
 
 		 401 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.4 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.21 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  25.41 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.93 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.79 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.79 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.45 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.79 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0585  heptosyltransferase-like protein  25.49 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000371878  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  24.78 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.79 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.43 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  24.78 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.79 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.79 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6399  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392534  normal  0.0454867 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0263  glycosyl transferase family 9  25.5 
 
 		 320 aa  67  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.951367  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.43 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  21.97 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  21.19 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  22.29 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.22 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  24.73 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  24.43 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  25.44 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.9 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  26.09 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.79 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  22.71 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.61 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4735  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 		 404 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  22.74 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  21.5 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2728  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  0.174728 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.13 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.51 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.75 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  24.31 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  22.16 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  24.53 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.51 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.51 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4835  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0140311  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2415  glycosyl transferase family 9  20.72 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0888849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  27.39 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  20.98 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.88 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  17.71 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.97 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  22.63 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4830  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.244067  hitchhiker  0.0000484932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.55 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>