63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3693 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3693  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase III  100 
 
 		 341 aa  706    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3928  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase III  57.53 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0012  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 		 356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0568378  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0327  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2604  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.17 
 
 		 345 aa  179  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0585  heptosyltransferase-like protein  26.88 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000371878  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0263  glycosyl transferase family 9  25.64 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.951367  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  26.28 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  26.33 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.53 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  23.92 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  23.33 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  23 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  23 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.2 
 
 		 516 aa  54.3  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  24.91 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  31.13 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  22.04 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 		 400 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4735  glycosyl transferase family protein  21.92 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  25.63 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2876  hypothetical protein  21.31 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.67 
 
 		 352 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 		 390 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  20.7 
 
 		 316 aa  49.3  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  20.35 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.22 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.21 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06145  hypothetical protein  24.75 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.871394  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0580  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  20.49 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.604166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  26.71 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  22.52 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.31 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  19.59 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  24.64 
 
 		 332 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4835  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 337 aa  46.2  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0140311  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.38 
 
 		 352 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.38 
 
 		 352 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1714  heptosyltransferase family protein  24.83 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  30.97 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.14 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2520  glycosyl transferase family protein  21.47 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  22.15 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  24.35 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.72 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  29.82 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  26.95 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.5 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.77 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  22.64 
 
 		 360 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  41.82 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  35.59 
 
 		 356 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.72 
 
 		 351 aa  43.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  18.15 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>