100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3928 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3928  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase III  100 
 
 		 333 aa  697    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3693  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase III  57.53 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0327  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0012  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0568378  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2604  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  34.01 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0585  heptosyltransferase-like protein  25.3 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000371878  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0263  glycosyl transferase family 9  25.82 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.951367  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  23.34 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  23.2 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  21.74 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.53 
 
 		 516 aa  70.1  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  23.58 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.05 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  24.57 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.77 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  25.15 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  21.45 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  37.5 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  22.74 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.69 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3731  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.26 
 
 		 382 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.37 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  21.75 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  23.08 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  24.1 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.36 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.02 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.89 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.33 
 
 		 415 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  25.59 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  25.25 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.7 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1275  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.7 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.336205  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3375  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2559  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6445  glycosyl transferase family protein  19.44 
 
 		 401 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0047484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1247  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.77 
 
 		 339 aa  49.3  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.313368  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.74 
 
 		 353 aa  49.7  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  21.34 
 
 		 335 aa  49.7  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1384  glycosyl transferase family protein  19.44 
 
 		 401 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.22 
 
 		 356 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0682  hypothetical protein  21.5 
 
 		 319 aa  49.3  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1150  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.03 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.16673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  30.97 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.63 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3215  glycosyl transferase family 9  21.84 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.573457  normal  0.197224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  20.57 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  29.47 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  29.17 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  19.44 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.52 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.26 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  20.72 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  22.35 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  21.05 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.44 
 
 		 352 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  20.8 
 
 		 378 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  21.84 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.55 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  26.67 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2415  glycosyl transferase family 9  23 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0888849  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.24 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.24 
 
 		 356 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.24 
 
 		 356 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.24 
 
 		 356 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0618  glycosyl transferase family 9  30.77 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  22.06 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0634  glycosyl transferase family 9  30.77 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.24 
 
 		 356 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1228  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.84 
 
 		 324 aa  46.2  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.07 
 
 		 362 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  21.92 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  17.92 
 
 		 400 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  28.69 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  22.42 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.84 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  20.97 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  21.11 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  26.32 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0580  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  21.75 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.604166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.85 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  20.76 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2520  glycosyl transferase family protein  22.08 
 
 		 354 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  21.58 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  28.57 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5042  glycosyl transferase family 9  20.39 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502044  normal  0.0534111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  26.79 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  20.52 
 
 		 402 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  21.18 
 
 		 370 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  19.68 
 
 		 344 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0159  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 		 381 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  22.06 
 
 		 361 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  20.62 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 333 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>