More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2174 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2174  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  69.4 
 
 		 145 aa  201  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.5 
 
 		 137 aa  190  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.14 
 
 		 138 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.31 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.49 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.15 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 141 aa  157  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.96 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 159 aa  148  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  52.14 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 160 aa  146  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 145 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 145 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 160 aa  143  7.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 159 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 145 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.06 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.92 
 
 		 184 aa  140  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 146 aa  140  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.43 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 		 173 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.71 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 144 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 144 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.86 
 
 		 155 aa  135  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.57 
 
 		 144 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 		 193 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.57 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 144 aa  133  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  45.71 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.97 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 		 150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 157 aa  130  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 158 aa  130  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  45.32 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  45.32 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  45.32 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 193 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1422  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>