99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0429 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0429  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 292 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.910101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0160  UbiA prenyltransferase  54.9 
 
 		 291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000799272  hitchhiker  0.000000000000598028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  52.05 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7263  UbiA prenyltransferase  52.7 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000688363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2286  UbiA prenyltransferase  43.07 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  31.16 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0780  UbiA prenyltransferase  33.11 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2631  UbiA prenyltransferase  42.16 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1557  UbiA prenyltransferase  30.11 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  34.86 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2325  UbiA prenyltransferase  28.14 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00527933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0986  UbiA prenyltransferase  34.03 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  35.57 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  32.64 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  31.52 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  27.84 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  27.66 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  35.38 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  30.2 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  28.85 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.22 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  32.35 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  34.34 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16384  predicted protein  34.57 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.960686  normal  0.418422 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  30.53 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  26.9 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  29.38 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.11 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.65 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.65 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2470  UbiA prenyltransferase  31.94 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0292823  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.65 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  38.75 
 
 		 315 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  28.57 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.91 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2426  UbiA prenyltransferase  39.77 
 
 		 250 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.7 
 
 		 376 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  26.8 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.25 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.92 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.64 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1824  UbiA prenyltransferase  37.21 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.547794  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.05 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  35.63 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  27.21 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  27.65 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  64.52 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.73 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  33.33 
 
 		 343 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.01 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3844  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.57 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  35.29 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.41 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.9 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.9 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  34.09 
 
 		 334 aa  46.6  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.71 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  42.86 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1866  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.62 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  33.68 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  29.73 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1892  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.62 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0278945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1782  UbiA prenyltransferase  25.77 
 
 		 247 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.71 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.77 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.05 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  33.7 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.88 
 
 		 307 aa  45.8  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  32.95 
 
 		 333 aa  45.8  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.69 
 
 		 332 aa  45.8  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  27.27 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  30.84 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.69 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  57.58 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.62 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  32.61 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.17 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  35.87 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1958  prenyltransferase  27.36 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  54.29 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0393  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.04 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.275276  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  29.67 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.33 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.71 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.15 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.15 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  25.55 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0951  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.21 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0270  protoheme IX farnesyltransferase  27.61 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.239431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  35.56 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  29.38 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.25 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  29.55 
 
 		 335 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  25.38 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0253  UbiA prenyltransferase  39.68 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0707527 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  32.03 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  32.63 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  32.63 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>