60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1557 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1557  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 284 aa  560  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2470  UbiA prenyltransferase  47.27 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0292823  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0986  UbiA prenyltransferase  37.76 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1824  UbiA prenyltransferase  41.54 
 
 		 250 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.547794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2426  UbiA prenyltransferase  41.54 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  37.99 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2286  UbiA prenyltransferase  40.28 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7263  UbiA prenyltransferase  33.51 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000688363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0429  UbiA prenyltransferase  30.11 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.910101 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0780  UbiA prenyltransferase  29.35 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  30.17 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0160  UbiA prenyltransferase  35.36 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000799272  hitchhiker  0.000000000000598028 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2631  UbiA prenyltransferase  32.77 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2325  UbiA prenyltransferase  33.11 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00527933  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  35 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  59.57 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  33.64 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  41.98 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  34.31 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  34.91 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  37.5 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  32.88 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  27.61 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  34.86 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  38.71 
 
 		 282 aa  49.7  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  36 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  32.47 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.49 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.21 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  29.32 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  30 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.14 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  33.33 
 
 		 280 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.78 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  39.74 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5673  protoheme IX farnesyltransferase  30.39 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  28.24 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.43 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.67 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  33.71 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0363  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.46 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  42.11 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0067  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.33 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.209668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0511  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.67 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.88 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3773  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.51 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  35.71 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.39 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3863  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.51 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.508575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0679  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.51 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  33.33 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.25 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.96 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  34.41 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3469  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  38 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal  0.729322 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  33.33 
 
 		 283 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3401  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.68 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  28.06 
 
 		 336 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  30.66 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>