37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2470 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2470  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 289 aa  549  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0292823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1557  UbiA prenyltransferase  47.27 
 
 		 284 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0986  UbiA prenyltransferase  42.09 
 
 		 292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1824  UbiA prenyltransferase  38.27 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.547794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2426  UbiA prenyltransferase  39.02 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7263  UbiA prenyltransferase  34.17 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000688363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0429  UbiA prenyltransferase  31.34 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.910101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2286  UbiA prenyltransferase  37.66 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0780  UbiA prenyltransferase  36.56 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2631  UbiA prenyltransferase  38.13 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  28.47 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0160  UbiA prenyltransferase  33.49 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000799272  hitchhiker  0.000000000000598028 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0288  UbiA prenyltransferase  34.07 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.16612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  37.14 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2325  UbiA prenyltransferase  46 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00527933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  28.44 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  47.83 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  36.17 
 
 		 289 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.35 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  31.03 
 
 		 333 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  38.89 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  31.53 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  30.47 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  38.39 
 
 		 335 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  30.08 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.92 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  33.04 
 
 		 282 aa  45.8  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  29.95 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  31.87 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  32.53 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  42.86 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  31.18 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  42.22 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  42.86 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  40 
 
 		 330 aa  42.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  30.47 
 
 		 334 aa  42.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>