156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2631 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2631  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
302 aa  597  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  42.93 
 
 
287 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7263  UbiA prenyltransferase  41.05 
 
 
300 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000688363  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2286  UbiA prenyltransferase  35.85 
 
 
309 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0429  UbiA prenyltransferase  42.16 
 
 
292 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.910101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  34.84 
 
 
289 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0160  UbiA prenyltransferase  38.1 
 
 
291 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000799272  hitchhiker  0.000000000000598028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0986  UbiA prenyltransferase  35.52 
 
 
292 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0780  UbiA prenyltransferase  42.25 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2325  UbiA prenyltransferase  43.06 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00527933  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1557  UbiA prenyltransferase  33.33 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  29.85 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  34.39 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  39.18 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1824  UbiA prenyltransferase  32.97 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.547794  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  46.27 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  46.27 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.61 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  37.5 
 
 
326 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2426  UbiA prenyltransferase  33.68 
 
 
250 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  36.36 
 
 
327 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  27.89 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2470  UbiA prenyltransferase  36.69 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0292823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  37.14 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  41.79 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  37.76 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.67 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.82 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.67 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  50.85 
 
 
285 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  31.78 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.73 
 
 
325 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.65 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.19 
 
 
302 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  33.93 
 
 
343 aa  55.8  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  47.17 
 
 
279 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  40.3 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.65 
 
 
320 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  40.3 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.19 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  40.3 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.67 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  33.06 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  31.01 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6422  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.19 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.04 
 
 
337 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.08 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  37.14 
 
 
339 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  35.79 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.29 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  35.05 
 
 
278 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2102  protoheme IX farnesyltransferase  35.88 
 
 
317 aa  52.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.36 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  55.56 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  32.45 
 
 
324 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  32.62 
 
 
336 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0046  UbiA prenyltransferase  35.4 
 
 
272 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000129053 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  34.02 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  36.73 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  42.55 
 
 
423 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.96 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  55.56 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  48.78 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  34.23 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.46 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  54.05 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.78 
 
 
315 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0288  UbiA prenyltransferase  32.41 
 
 
241 aa  50.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.16612  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.85 
 
 
336 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  39.19 
 
 
304 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  43.48 
 
 
316 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  55.26 
 
 
300 aa  49.3  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  35.14 
 
 
333 aa  48.9  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.71 
 
 
295 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  55.26 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  31.78 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  37.62 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  55.26 
 
 
334 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  32.86 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.78 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  32.17 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.63 
 
 
295 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  55.26 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  32.17 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  69.23 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  32.86 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  69.23 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  28.93 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  55.26 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  40 
 
 
297 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1852  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.38 
 
 
294 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409299 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0541  protoheme IX farnesyltransferase  29.31 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  35.71 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0486  protoheme IX farnesyltransferase  29.31 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55861  normal  0.0113191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0480  protoheme IX farnesyltransferase  29.31 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0953207  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  31.47 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0478  protoheme IX farnesyltransferase  29.31 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0633595  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  37.5 
 
 
338 aa  46.2  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1291  protoheme IX farnesyltransferase  35 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000335435  hitchhiker  0.00464829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3844  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.2 
 
 
340 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>