141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2325 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2325  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
292 aa  528  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00527933  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  56.64 
 
 
287 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0429  UbiA prenyltransferase  30.54 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.910101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2631  UbiA prenyltransferase  46.67 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0160  UbiA prenyltransferase  32.52 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000799272  hitchhiker  0.000000000000598028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7263  UbiA prenyltransferase  30.77 
 
 
300 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000688363  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2286  UbiA prenyltransferase  32.37 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1557  UbiA prenyltransferase  34.62 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0986  UbiA prenyltransferase  36.21 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  43.04 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0780  UbiA prenyltransferase  36.03 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  33.74 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1824  UbiA prenyltransferase  39.36 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.547794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2426  UbiA prenyltransferase  39.36 
 
 
250 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  63.64 
 
 
259 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  49.18 
 
 
282 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  50 
 
 
281 aa  56.2  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  55.81 
 
 
267 aa  55.8  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  39.19 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  46.75 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  44.68 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2470  UbiA prenyltransferase  38.17 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0292823  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  48.89 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  47.62 
 
 
330 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  48.78 
 
 
325 aa  52.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  46.67 
 
 
326 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  48.89 
 
 
423 aa  53.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  33.59 
 
 
284 aa  52.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  41.41 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  30.39 
 
 
291 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.88 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.88 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  37.89 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  44.44 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  47.5 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.14 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  40.86 
 
 
327 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  45 
 
 
320 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  47.92 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  46.34 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  44.83 
 
 
317 aa  49.7  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  44.44 
 
 
318 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  37.35 
 
 
339 aa  49.7  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  39.39 
 
 
333 aa  49.7  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2632  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  44.07 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3316  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.18 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3350  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.18 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2582  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.18 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  58.82 
 
 
284 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  42.86 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.3 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  46.81 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2519  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  58.14 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.917266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  37.88 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  38.3 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.18 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  42.22 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3361  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.18 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230126  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  39.39 
 
 
334 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  47.27 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.8 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  46.81 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  25.77 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  33.33 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  40.82 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.3 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  43.1 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  39.39 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  43.66 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  37.33 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0312  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.18 
 
 
370 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1173  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.18 
 
 
370 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  46.94 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.76 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1892  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  64 
 
 
326 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0278945  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  41.18 
 
 
333 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1866  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  64 
 
 
326 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0288  UbiA prenyltransferase  37 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.16612  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  38.75 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1286  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  57.14 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0245  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.49 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0729  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.49 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  38.75 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2657  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.49 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5365  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  46.43 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.346697 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0697  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.49 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370156  normal  0.206083 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16384  predicted protein  46.34 
 
 
317 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.960686  normal  0.418422 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  53.33 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2061  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  46.94 
 
 
309 aa  46.2  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.62 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3844  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  60 
 
 
340 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2509  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.06 
 
 
291 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  40.26 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2921  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.06 
 
 
280 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472236  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  44.68 
 
 
274 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  39.71 
 
 
333 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5318  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.64 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  33.33 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.92 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  34.92 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>