102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2286 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2286  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
309 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0160  UbiA prenyltransferase  48.63 
 
 
291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000799272  hitchhiker  0.000000000000598028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7263  UbiA prenyltransferase  48.65 
 
 
300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000688363  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  47.97 
 
 
289 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0429  UbiA prenyltransferase  43.34 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.910101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2631  UbiA prenyltransferase  36.6 
 
 
302 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  30.98 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0986  UbiA prenyltransferase  35.33 
 
 
292 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0780  UbiA prenyltransferase  32.73 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1557  UbiA prenyltransferase  40.28 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  36.11 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  31.06 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  31.25 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  31.79 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  32.69 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1824  UbiA prenyltransferase  35.1 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.547794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2325  UbiA prenyltransferase  30.6 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00527933  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  29.85 
 
 
282 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  32.34 
 
 
281 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  36.36 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  30.2 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  31.52 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  25.76 
 
 
283 aa  59.3  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2470  UbiA prenyltransferase  39.56 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0292823  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.82 
 
 
278 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  37.37 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2426  UbiA prenyltransferase  34.46 
 
 
250 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.05 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  31.13 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  33.61 
 
 
334 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.77 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.77 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.77 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 
280 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2632  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  39.67 
 
 
310 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.07 
 
 
315 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  30 
 
 
185 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  32.9 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  37.5 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  37.5 
 
 
333 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  30.61 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16384  predicted protein  28.57 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.960686  normal  0.418422 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.49 
 
 
339 aa  50.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  32.98 
 
 
334 aa  49.7  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.3 
 
 
333 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  31.18 
 
 
288 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.74 
 
 
336 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  40 
 
 
259 aa  49.7  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.64 
 
 
376 aa  48.9  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.74 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  30.53 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  32.59 
 
 
277 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.61 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  29.03 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  35.56 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.03 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.61 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  28.71 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  31.96 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.53 
 
 
333 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  32 
 
 
284 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  31.91 
 
 
327 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.5 
 
 
319 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  30 
 
 
279 aa  46.2  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2075  protoheme IX farnesyltransferase  25.68 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126082  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  31.82 
 
 
305 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.56 
 
 
342 aa  45.8  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.77 
 
 
284 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  31.48 
 
 
423 aa  45.8  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0572  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  32.76 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.33 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  30.69 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.6 
 
 
318 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  39.74 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.13 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1225  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.13 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  29.37 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  29.03 
 
 
343 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  28.21 
 
 
317 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  30.6 
 
 
324 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2904  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  38.55 
 
 
329 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.520314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  28.48 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.79 
 
 
337 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.67 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  26.43 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.92 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2247  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  40 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0799329  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  39.62 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.62 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  57.14 
 
 
337 aa  42.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0653  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  37.08 
 
 
340 aa  42.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110294  normal  0.440734 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  26.43 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  39.62 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2246  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.95 
 
 
326 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0326669  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  26.43 
 
 
300 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1892  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.12 
 
 
326 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0278945  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.77 
 
 
307 aa  42.4  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  28.18 
 
 
291 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>