More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2107 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2107  NLPA lipoprotein  100 
 
 
316 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1824  ABC methionine transporter, periplasmic solute binding protein metQ  97.13 
 
 
317 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0865754  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1415  NLPA lipoprotein  71.34 
 
 
299 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.799942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1551  putative outer membrane lipoprotein  45.93 
 
 
274 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4988  NLPA lipoprotein  45.63 
 
 
270 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563314  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3786  NLPA lipoprotein  46.41 
 
 
273 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4596  NLPA lipoprotein  44.31 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.623708 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0403  NLPA lipoprotein  39.26 
 
 
291 aa  186  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203818  normal  0.319988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1592  NLPA lipoprotein  40.79 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2399  NLPA lipoprotein  40 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0559  lipoprotein  41.67 
 
 
276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0564  lipoprotein  41 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0557  lipoprotein  41 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679973  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0618  lipoprotein  41 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0574  lipoprotein  41 
 
 
276 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.914687  normal  0.470219 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0972  NLPA lipoprotein  40.35 
 
 
277 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2299  NLPA lipoprotein  38.4 
 
 
281 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  37.14 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  41.67 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  38.24 
 
 
264 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0144  putative NLPA lipoprotein  36.25 
 
 
283 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.157952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  40.26 
 
 
264 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1561  putative outer membrane lipoprotein  34.25 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  40 
 
 
259 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  36.25 
 
 
282 aa  166  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  39.32 
 
 
258 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  39.32 
 
 
258 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  42.13 
 
 
261 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  36.96 
 
 
266 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  39.57 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  39.32 
 
 
258 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3438  NLPA lipoprotein  40 
 
 
273 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  38.4 
 
 
262 aa  162  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1947  NLPA lipoprotein  38.21 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  40.85 
 
 
263 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  37.18 
 
 
263 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  39.33 
 
 
262 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1680  NLPA lipoprotein  37.8 
 
 
281 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000082147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  40 
 
 
263 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  38.8 
 
 
271 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.7 
 
 
271 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  41.36 
 
 
260 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  38.63 
 
 
257 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  38.93 
 
 
270 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  41.4 
 
 
270 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.91 
 
 
270 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  37.13 
 
 
258 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  39.5 
 
 
274 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  38.31 
 
 
265 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  39.24 
 
 
259 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  38.03 
 
 
276 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.68 
 
 
271 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  38.46 
 
 
271 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  37.7 
 
 
271 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  36.9 
 
 
271 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  37.6 
 
 
275 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  37.7 
 
 
271 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  39.48 
 
 
258 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  40 
 
 
268 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  42.06 
 
 
281 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  40.08 
 
 
268 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  40.08 
 
 
268 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  40.51 
 
 
257 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  40 
 
 
260 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  41.52 
 
 
260 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  36.51 
 
 
271 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  36.51 
 
 
271 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  36.51 
 
 
271 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  38.3 
 
 
272 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  37.97 
 
 
272 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  38.3 
 
 
272 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  38.3 
 
 
281 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  38.3 
 
 
272 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  38.3 
 
 
272 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  41.82 
 
 
260 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  40.08 
 
 
257 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  41.99 
 
 
266 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  38.3 
 
 
272 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  38.3 
 
 
272 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2531  NLPA lipoprotein  35.66 
 
 
269 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2218  NLPA lipoprotein  36.07 
 
 
269 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  39.66 
 
 
268 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  39.68 
 
 
268 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  39.68 
 
 
268 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  38.37 
 
 
268 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3291  putative D-methionine ABC transporter, perisplasmic binding lipoprotein  37 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  41.56 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.57 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  36.4 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  38.3 
 
 
272 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  40.69 
 
 
266 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  38.32 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  34.98 
 
 
270 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.68 
 
 
271 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.68 
 
 
271 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.68 
 
 
271 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.68 
 
 
271 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.68 
 
 
271 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  39.06 
 
 
265 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  40.26 
 
 
266 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>