More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1415 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1415  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 299 aa  611  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799942 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1824  ABC methionine transporter, periplasmic solute binding protein metQ  71.24 
 
 		 317 aa  450  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0865754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2107  NLPA lipoprotein  70.06 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1551  putative outer membrane lipoprotein  49.17 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3786  NLPA lipoprotein  49.59 
 
 		 273 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4988  NLPA lipoprotein  48.54 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563314  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4596  NLPA lipoprotein  47.95 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2399  NLPA lipoprotein  42.58 
 
 		 281 aa  195  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0403  NLPA lipoprotein  38.81 
 
 		 291 aa  193  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203818  normal  0.319988 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0557  lipoprotein  43.1 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679973  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0564  lipoprotein  43.1 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0618  lipoprotein  43.1 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1592  NLPA lipoprotein  36.65 
 
 		 285 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2299  NLPA lipoprotein  43.97 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0574  lipoprotein  43.11 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.914687  normal  0.470219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0559  lipoprotein  42.67 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0972  NLPA lipoprotein  39.53 
 
 		 277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1561  putative outer membrane lipoprotein  34.63 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0144  putative NLPA lipoprotein  37.86 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.157952 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1947  NLPA lipoprotein  42.24 
 
 		 281 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1680  NLPA lipoprotein  43.64 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000082147  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  41.1 
 
 		 264 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  40.76 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  41.6 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  40.34 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2531  NLPA lipoprotein  41.03 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  41.42 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2218  NLPA lipoprotein  41.03 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  38.13 
 
 		 276 aa  173  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3291  putative D-methionine ABC transporter, perisplasmic binding lipoprotein  37.97 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  41.13 
 
 		 257 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  36.4 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3438  NLPA lipoprotein  40.43 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  41.95 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  41 
 
 		 278 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  41.53 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  41.18 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  40.09 
 
 		 258 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  40.09 
 
 		 258 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  40.09 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  37.76 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  38.46 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  39.29 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  39.84 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  36.88 
 
 		 270 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.23 
 
 		 270 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  39.66 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  37.59 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  37.59 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  35.66 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.59 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  37.59 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.8 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  37.59 
 
 		 270 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  39.17 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  35.97 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  37.34 
 
 		 263 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  35.82 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  41.25 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  37.3 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  40.08 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  40.34 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  37.39 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  36.86 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.1 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  39.6 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.73 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  38.89 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.1 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  39.92 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.1 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.1 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.1 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.96 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  40.87 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  36.86 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  38.26 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  39.59 
 
 		 270 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  40 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  39.83 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  40.17 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  40.42 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  40.42 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  37.36 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.36 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.36 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  37.36 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.83 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.83 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.83 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.36 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0888  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.96 
 
 		 269 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.83 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  40.83 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  39.83 
 
 		 281 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  40.83 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.36 
 
 		 271 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.36 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>