More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2218 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2218  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 269 aa  543  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2531  NLPA lipoprotein  97.03 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3438  NLPA lipoprotein  77.41 
 
 		 273 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2399  NLPA lipoprotein  65.25 
 
 		 281 aa  354  8.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2299  NLPA lipoprotein  65.25 
 
 		 281 aa  352  2.9999999999999997e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0557  lipoprotein  63.71 
 
 		 276 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1680  NLPA lipoprotein  63.71 
 
 		 281 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000082147  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0564  lipoprotein  63.71 
 
 		 276 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0618  lipoprotein  63.71 
 
 		 276 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0574  lipoprotein  63.32 
 
 		 276 aa  341  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.914687  normal  0.470219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0559  lipoprotein  63.32 
 
 		 276 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1947  NLPA lipoprotein  62.55 
 
 		 281 aa  337  8e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0972  NLPA lipoprotein  61.78 
 
 		 277 aa  331  9e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3786  NLPA lipoprotein  46.67 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4596  NLPA lipoprotein  45.82 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1551  putative outer membrane lipoprotein  45.17 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4988  NLPA lipoprotein  42.86 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563314  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0403  NLPA lipoprotein  43.24 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203818  normal  0.319988 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  41.95 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  41.83 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  43.72 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  43.72 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1561  putative outer membrane lipoprotein  39.13 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  40.33 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  39.68 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  39.51 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  39.51 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  39.51 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1415  NLPA lipoprotein  41.03 
 
 		 299 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799942 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  39.09 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  39.51 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  39.51 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  39.51 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  39.51 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  38.82 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  40.25 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  41.74 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0144  putative NLPA lipoprotein  36.84 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.157952 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  42.06 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  40.22 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  39.26 
 
 		 278 aa  168  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  42.15 
 
 		 281 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  39.77 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.15 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.15 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  39.39 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.15 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.15 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  39.39 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.15 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  39.39 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  36.6 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  39.74 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  40.32 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  36.23 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  39.02 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  41.74 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  39.02 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  37.16 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  38.79 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  39.76 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  40.83 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  39.39 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  42.19 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  38.38 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  42.19 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  38.38 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  38.01 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.32 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  41.42 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  38.01 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  38.01 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  41.56 
 
 		 278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  39.52 
 
 		 263 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  41.77 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  41.56 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  39.33 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  39.59 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  39.2 
 
 		 259 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3291  putative D-methionine ABC transporter, perisplasmic binding lipoprotein  37.14 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  35.86 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  39.37 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  35.86 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  37.64 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  38.91 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  40.16 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  38.66 
 
 		 264 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  38.91 
 
 		 311 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  38.71 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  39.57 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  38.71 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  38.71 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  38.71 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  38.71 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  38.71 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  40.27 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  35.46 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  40.77 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  41.92 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  40.25 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>