More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4988 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4988  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563314  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1551  putative outer membrane lipoprotein  77.73 
 
 		 274 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3786  NLPA lipoprotein  60 
 
 		 273 aa  312  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4596  NLPA lipoprotein  54.1 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2399  NLPA lipoprotein  49.09 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1680  NLPA lipoprotein  46.91 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000082147  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0557  lipoprotein  46.67 
 
 		 276 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679973  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0564  lipoprotein  46.67 
 
 		 276 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0618  lipoprotein  46.67 
 
 		 276 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1947  NLPA lipoprotein  46.91 
 
 		 281 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0574  lipoprotein  46.3 
 
 		 276 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.914687  normal  0.470219 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2299  NLPA lipoprotein  47.92 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0972  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 277 aa  245  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0559  lipoprotein  45.93 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1824  ABC methionine transporter, periplasmic solute binding protein metQ  46.5 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0865754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1415  NLPA lipoprotein  48.54 
 
 		 299 aa  235  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799942 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2107  NLPA lipoprotein  46.5 
 
 		 316 aa  235  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1592  NLPA lipoprotein  47.79 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1561  putative outer membrane lipoprotein  46.82 
 
 		 291 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3438  NLPA lipoprotein  42.86 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2531  NLPA lipoprotein  42.86 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2218  NLPA lipoprotein  42.86 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0144  putative NLPA lipoprotein  45.64 
 
 		 283 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.157952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3291  putative D-methionine ABC transporter, perisplasmic binding lipoprotein  42.54 
 
 		 275 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  46.47 
 
 		 278 aa  208  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0403  NLPA lipoprotein  44.03 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203818  normal  0.319988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  43.35 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  43.4 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  42.02 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.4 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  45.42 
 
 		 264 aa  201  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  45.57 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  41.31 
 
 		 259 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  41.63 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  43.75 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  41.25 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  42.64 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  45.8 
 
 		 265 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  44.76 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  44.23 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  44.06 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  44.76 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  44.23 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  40.96 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  46.22 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  41.29 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  46.67 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  43.3 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  46.22 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  46.22 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  46.22 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  43.03 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  44.63 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  44.63 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  45.49 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  40.22 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.63 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.63 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.63 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  45.38 
 
 		 264 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.63 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  40.22 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.63 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  40.22 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  43.44 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  40.98 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  43.43 
 
 		 280 aa  188  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  39.85 
 
 		 271 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  39.85 
 
 		 271 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  41.22 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  39.85 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  43.36 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  45.38 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  47.28 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  45.38 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  40.3 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  42.58 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.21 
 
 		 272 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  41.15 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  41.6 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  41.15 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  43.7 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  40.37 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  41.98 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  43.28 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  40.98 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2603  lipoprotein, YaeC family  39.92 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.946899  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  40.98 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  42.62 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  42.04 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  40.38 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  42.67 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  40.57 
 
 		 268 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  40.34 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  40.15 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  43.22 
 
 		 263 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  41.39 
 
 		 529 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  40.34 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  40.38 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  40.62 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>