More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1592 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1592  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1561  putative outer membrane lipoprotein  62.14 
 
 		 291 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3291  putative D-methionine ABC transporter, perisplasmic binding lipoprotein  65.65 
 
 		 275 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0144  putative NLPA lipoprotein  68.33 
 
 		 283 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.157952 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4988  NLPA lipoprotein  44.93 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563314  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1551  putative outer membrane lipoprotein  42.59 
 
 		 274 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4596  NLPA lipoprotein  41.46 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3786  NLPA lipoprotein  40.22 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1415  NLPA lipoprotein  36.65 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799942 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0564  lipoprotein  37.36 
 
 		 276 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0618  lipoprotein  37.36 
 
 		 276 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0557  lipoprotein  37.36 
 
 		 276 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0559  lipoprotein  37.36 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0574  lipoprotein  37.36 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.914687  normal  0.470219 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2107  NLPA lipoprotein  40.79 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0972  NLPA lipoprotein  37.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1824  ABC methionine transporter, periplasmic solute binding protein metQ  40.79 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0865754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0403  NLPA lipoprotein  36.33 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203818  normal  0.319988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2399  NLPA lipoprotein  36.64 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2299  NLPA lipoprotein  38.25 
 
 		 281 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3438  NLPA lipoprotein  38.27 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1680  NLPA lipoprotein  35.09 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000082147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1947  NLPA lipoprotein  35.5 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  38.98 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  34.98 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  39.47 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  37.78 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  36.55 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2603  lipoprotein, YaeC family  36.82 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.946899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.36 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  38.93 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  38.93 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  37.18 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  36.36 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  38.17 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  35.98 
 
 		 262 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  36.4 
 
 		 256 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  38.56 
 
 		 260 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2218  NLPA lipoprotein  34.4 
 
 		 269 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  37.65 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  35.71 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  35.71 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2531  NLPA lipoprotein  33.2 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  35.56 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  37.64 
 
 		 265 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  37.35 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  33.82 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  36.5 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  35.25 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  36.5 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  35.11 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  38.74 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  40.79 
 
 		 265 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  35.77 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  35.77 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  36.82 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  35.77 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  35.77 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  41.67 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  37.27 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  32.98 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0778  lipoprotein YaeC  39.82 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  38.93 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  36.9 
 
 		 266 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  38.22 
 
 		 264 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  36.55 
 
 		 259 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  36.47 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  35.95 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.88 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  35.96 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  35.96 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  36.91 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  39.91 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  35.96 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3792  YaeC family lipoprotein  35.43 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293535  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  35.96 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  35.96 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  37.28 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  38.26 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  35.16 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  37.93 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  34.51 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.28 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.28 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  37.28 
 
 		 281 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.28 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.28 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  35.58 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.28 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  35.25 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  35.25 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  36.07 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  39.65 
 
 		 264 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  39.5 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  37.3 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  39.21 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  39.21 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  33.21 
 
 		 261 aa  145  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  34.87 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  34.73 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>