More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0144 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0144  putative NLPA lipoprotein  100 
 
 
283 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.157952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1561  putative outer membrane lipoprotein  84.25 
 
 
291 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1592  NLPA lipoprotein  68.33 
 
 
285 aa  348  8e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3291  putative D-methionine ABC transporter, perisplasmic binding lipoprotein  60.67 
 
 
275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1551  putative outer membrane lipoprotein  44.7 
 
 
274 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4988  NLPA lipoprotein  44.06 
 
 
270 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563314  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3786  NLPA lipoprotein  38.99 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4596  NLPA lipoprotein  39.84 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.623708 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1415  NLPA lipoprotein  37.15 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.799942 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0403  NLPA lipoprotein  36.18 
 
 
291 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203818  normal  0.319988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2218  NLPA lipoprotein  37.31 
 
 
269 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0618  lipoprotein  36.19 
 
 
276 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0564  lipoprotein  36.19 
 
 
276 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0557  lipoprotein  36.19 
 
 
276 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0972  NLPA lipoprotein  36.47 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0559  lipoprotein  35.82 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2531  NLPA lipoprotein  36.19 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0574  lipoprotein  35.45 
 
 
276 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.914687  normal  0.470219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1824  ABC methionine transporter, periplasmic solute binding protein metQ  36.67 
 
 
317 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0865754  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2107  NLPA lipoprotein  36.25 
 
 
316 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2299  NLPA lipoprotein  37.14 
 
 
281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1680  NLPA lipoprotein  35.29 
 
 
281 aa  165  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000082147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2399  NLPA lipoprotein  36.1 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1947  NLPA lipoprotein  34.56 
 
 
281 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  34.09 
 
 
256 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  34.38 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3438  NLPA lipoprotein  33.96 
 
 
273 aa  155  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  34.09 
 
 
256 aa  155  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  37.01 
 
 
273 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  34.09 
 
 
256 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  36.33 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  38 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  36.64 
 
 
264 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  33.59 
 
 
257 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  37.26 
 
 
258 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  35.96 
 
 
260 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  37.26 
 
 
258 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  33.59 
 
 
257 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  34.67 
 
 
261 aa  149  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  35.38 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  35.42 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  35.57 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  35.58 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  35.25 
 
 
256 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  36.78 
 
 
259 aa  147  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2603  lipoprotein, YaeC family  33.33 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.946899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  33.21 
 
 
271 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  35.38 
 
 
258 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  36.44 
 
 
268 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  36.44 
 
 
268 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.52 
 
 
270 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  34.96 
 
 
268 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  33.96 
 
 
271 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  33.96 
 
 
271 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  33.96 
 
 
271 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  34.84 
 
 
262 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  38.68 
 
 
265 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  32.97 
 
 
277 aa  144  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  33.21 
 
 
271 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  36.03 
 
 
268 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  33.21 
 
 
271 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  33.21 
 
 
271 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  34.33 
 
 
270 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  36.07 
 
 
268 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  36.36 
 
 
256 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  36.48 
 
 
268 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  36.43 
 
 
297 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  36.76 
 
 
266 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  35.69 
 
 
265 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  36.76 
 
 
266 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3792  YaeC family lipoprotein  36.17 
 
 
265 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293535  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  37.9 
 
 
266 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  33.81 
 
 
270 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  36.36 
 
 
264 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  34.43 
 
 
262 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  35.52 
 
 
266 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  36.36 
 
 
258 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  34.94 
 
 
271 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  36.12 
 
 
258 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  35.52 
 
 
269 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  35.52 
 
 
259 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  35.52 
 
 
269 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  35.52 
 
 
259 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  35.22 
 
 
529 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  35.81 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  39.19 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  37.84 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  37.23 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  35.52 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  38.03 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  39.24 
 
 
266 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  32.51 
 
 
282 aa  140  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  34.71 
 
 
268 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  35.66 
 
 
268 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  35.52 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  35.66 
 
 
268 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  36.21 
 
 
264 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  33.46 
 
 
259 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  36.07 
 
 
269 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  37.61 
 
 
264 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>