More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1551 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1551  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 
274 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4988  NLPA lipoprotein  77.73 
 
 
270 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563314  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3786  NLPA lipoprotein  55.68 
 
 
273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4596  NLPA lipoprotein  56.5 
 
 
276 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.623708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2399  NLPA lipoprotein  51.3 
 
 
281 aa  265  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1680  NLPA lipoprotein  51.94 
 
 
281 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000082147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2299  NLPA lipoprotein  51.94 
 
 
281 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0557  lipoprotein  49.45 
 
 
276 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679973  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0564  lipoprotein  49.45 
 
 
276 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0618  lipoprotein  49.45 
 
 
276 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1947  NLPA lipoprotein  51.55 
 
 
281 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0972  NLPA lipoprotein  48.91 
 
 
277 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0574  lipoprotein  49.09 
 
 
276 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.914687  normal  0.470219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0559  lipoprotein  48.73 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1824  ABC methionine transporter, periplasmic solute binding protein metQ  47.97 
 
 
317 aa  246  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0865754  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2107  NLPA lipoprotein  47.97 
 
 
316 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1415  NLPA lipoprotein  49.17 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.799942 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3438  NLPA lipoprotein  44.49 
 
 
273 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1561  putative outer membrane lipoprotein  43.43 
 
 
291 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2531  NLPA lipoprotein  45.17 
 
 
269 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2218  NLPA lipoprotein  45.17 
 
 
269 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1592  NLPA lipoprotein  43.14 
 
 
285 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0144  putative NLPA lipoprotein  45 
 
 
283 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.157952 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0403  NLPA lipoprotein  44.9 
 
 
291 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203818  normal  0.319988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  48.75 
 
 
278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  48.05 
 
 
257 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  44.74 
 
 
266 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.44 
 
 
270 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  46.04 
 
 
266 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  46.04 
 
 
266 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  46.55 
 
 
264 aa  201  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  44.03 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  44.4 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  44.4 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  44.07 
 
 
270 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3291  putative D-methionine ABC transporter, perisplasmic binding lipoprotein  40.32 
 
 
275 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  43.28 
 
 
271 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  43.28 
 
 
271 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  44.3 
 
 
263 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  43.28 
 
 
271 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  45.04 
 
 
263 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  42.91 
 
 
271 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  44.94 
 
 
272 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  43.82 
 
 
270 aa  194  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  46 
 
 
265 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  45.93 
 
 
272 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  46.9 
 
 
281 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  45.93 
 
 
281 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  45.93 
 
 
272 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  45.93 
 
 
272 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  45.93 
 
 
272 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  45.93 
 
 
272 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  45.93 
 
 
272 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  40.51 
 
 
259 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  44.06 
 
 
264 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  44.59 
 
 
260 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  42.03 
 
 
264 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  45.74 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  41.48 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  45.74 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  45.87 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.54 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  45.12 
 
 
272 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  41.37 
 
 
278 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  43.48 
 
 
280 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  44.59 
 
 
260 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  47.44 
 
 
265 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  42.8 
 
 
268 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  43.02 
 
 
265 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  45.9 
 
 
264 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  42.8 
 
 
268 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  40.43 
 
 
277 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  40.32 
 
 
258 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  40.32 
 
 
258 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  45.69 
 
 
265 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  46.58 
 
 
264 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  42.39 
 
 
268 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  46.58 
 
 
264 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  42.8 
 
 
268 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  46.58 
 
 
264 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  46.15 
 
 
264 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  42.8 
 
 
268 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  44.16 
 
 
261 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  47.39 
 
 
266 aa  185  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  41.15 
 
 
268 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  40.44 
 
 
269 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  40.44 
 
 
269 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  42.64 
 
 
270 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  39.78 
 
 
259 aa  184  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  45.3 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  41.46 
 
 
275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  39.42 
 
 
259 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  41.03 
 
 
297 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  41.77 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  41.6 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  40.45 
 
 
266 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  42.55 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  40.93 
 
 
259 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  40.59 
 
 
268 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  40.93 
 
 
259 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>