More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1680 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1680  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 281 aa  567  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000082147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1947  NLPA lipoprotein  96.8 
 
 		 281 aa  551  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2299  NLPA lipoprotein  83.99 
 
 		 281 aa  490  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2399  NLPA lipoprotein  82.92 
 
 		 281 aa  485  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0972  NLPA lipoprotein  73.65 
 
 		 277 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0557  lipoprotein  74.82 
 
 		 276 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0559  lipoprotein  74.45 
 
 		 276 aa  417  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0564  lipoprotein  74.82 
 
 		 276 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0618  lipoprotein  74.82 
 
 		 276 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0574  lipoprotein  74.09 
 
 		 276 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.914687  normal  0.470219 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2531  NLPA lipoprotein  64.09 
 
 		 269 aa  345  6e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2218  NLPA lipoprotein  63.71 
 
 		 269 aa  342  4e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3438  NLPA lipoprotein  62.65 
 
 		 273 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1551  putative outer membrane lipoprotein  51.94 
 
 		 274 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4988  NLPA lipoprotein  46.91 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563314  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0403  NLPA lipoprotein  47.37 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203818  normal  0.319988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3786  NLPA lipoprotein  44.93 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4596  NLPA lipoprotein  45.82 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623708 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1415  NLPA lipoprotein  43.64 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3291  putative D-methionine ABC transporter, perisplasmic binding lipoprotein  36.23 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  42.86 
 
 		 258 aa  171  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  40.61 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  41.95 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  40.96 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  40.96 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1592  NLPA lipoprotein  35.08 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  41.48 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  41.63 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  40.17 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  43.78 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  40.56 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  42.72 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  43.19 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0144  putative NLPA lipoprotein  35.86 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.157952 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1824  ABC methionine transporter, periplasmic solute binding protein metQ  38.59 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0865754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2107  NLPA lipoprotein  38.17 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  39.15 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1561  putative outer membrane lipoprotein  38.03 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  37.28 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  38.98 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  40.09 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  39.92 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  37.44 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  41.28 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  38.49 
 
 		 277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  38.91 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  36.4 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  38.91 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  38.91 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  38.43 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  41.63 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  38.46 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  38.96 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  38.36 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  45.06 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  40.85 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  41.51 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  39.04 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  43.53 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  40.54 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  38.46 
 
 		 256 aa  153  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  40.3 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  38.36 
 
 		 260 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  37.71 
 
 		 281 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  38.53 
 
 		 259 aa  152  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  40.09 
 
 		 278 aa  151  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.82 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.82 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.82 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  39.32 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  40.5 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  39.57 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  41.82 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.82 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  39.57 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  41.31 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.82 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  41.82 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  40.93 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  40 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  41.35 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  40 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  41.35 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  40 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  38.06 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.91 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  37.28 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  42.18 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  40.91 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  40.91 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  43.59 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  41.94 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  36.96 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  39.39 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.91 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  42.08 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  41.89 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  44.29 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  37.39 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  37.4 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>