More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3438 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3438  NLPA lipoprotein  100 
 
 
273 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2218  NLPA lipoprotein  77.41 
 
 
269 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2531  NLPA lipoprotein  76.3 
 
 
269 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2299  NLPA lipoprotein  59.35 
 
 
281 aa  332  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2399  NLPA lipoprotein  62.4 
 
 
281 aa  331  8e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0564  lipoprotein  60.67 
 
 
276 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0618  lipoprotein  60.67 
 
 
276 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0557  lipoprotein  60.67 
 
 
276 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679973  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0574  lipoprotein  60.3 
 
 
276 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.914687  normal  0.470219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1680  NLPA lipoprotein  62.65 
 
 
281 aa  323  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000082147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0559  lipoprotein  59.93 
 
 
276 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1947  NLPA lipoprotein  61.48 
 
 
281 aa  317  9e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0972  NLPA lipoprotein  57.89 
 
 
277 aa  314  8e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3786  NLPA lipoprotein  47.45 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4596  NLPA lipoprotein  47.22 
 
 
276 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.623708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1551  putative outer membrane lipoprotein  44.49 
 
 
274 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4988  NLPA lipoprotein  42.86 
 
 
270 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563314  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0403  NLPA lipoprotein  46.25 
 
 
291 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203818  normal  0.319988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  40.94 
 
 
258 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  43.44 
 
 
258 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  43.44 
 
 
258 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  43.85 
 
 
258 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  43.28 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  43.28 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  43.28 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.11 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  40.85 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  42.86 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  42.86 
 
 
273 aa  170  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1592  NLPA lipoprotein  38.27 
 
 
285 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1415  NLPA lipoprotein  40.43 
 
 
299 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.799942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  38.1 
 
 
270 aa  168  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  38.1 
 
 
270 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.06 
 
 
270 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  38.1 
 
 
270 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.1 
 
 
270 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.7 
 
 
270 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  38.1 
 
 
270 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  42.44 
 
 
268 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  42.44 
 
 
268 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.7 
 
 
270 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  40.08 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  42.44 
 
 
268 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  38.31 
 
 
278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  37.3 
 
 
270 aa  165  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  41.77 
 
 
266 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  37.45 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  40.47 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  37.04 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  40.33 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  40 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  40 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2107  NLPA lipoprotein  40 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  41.41 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  37.9 
 
 
261 aa  162  7e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  37.86 
 
 
259 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1824  ABC methionine transporter, periplasmic solute binding protein metQ  39.57 
 
 
317 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0865754  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  39.2 
 
 
297 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  38.1 
 
 
259 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  39.15 
 
 
260 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  40.82 
 
 
271 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  39.62 
 
 
256 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  40.82 
 
 
271 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  40 
 
 
272 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  40 
 
 
281 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  36 
 
 
257 aa  158  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  39.57 
 
 
264 aa  158  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  38.19 
 
 
270 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.43 
 
 
272 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  39.91 
 
 
278 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.43 
 
 
272 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  40.43 
 
 
281 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.43 
 
 
272 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1561  putative outer membrane lipoprotein  35.95 
 
 
291 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.43 
 
 
272 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.43 
 
 
272 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  36 
 
 
257 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  38.1 
 
 
259 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  41.99 
 
 
265 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  40 
 
 
271 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  40 
 
 
271 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  38.1 
 
 
259 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  40 
 
 
271 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  36.96 
 
 
269 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  39.3 
 
 
260 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  36.64 
 
 
256 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  36.96 
 
 
269 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  36.96 
 
 
266 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.41 
 
 
270 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  36.63 
 
 
258 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  40 
 
 
272 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  37.99 
 
 
256 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3291  putative D-methionine ABC transporter, perisplasmic binding lipoprotein  37.7 
 
 
275 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  37.99 
 
 
256 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  39.41 
 
 
270 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  35.94 
 
 
276 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  39.59 
 
 
271 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  37.99 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  38.35 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  37.99 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>