181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0177 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0177  K+ transport systems, NAD-binding component  100 
 
 		 508 aa  1036    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000132187  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1796  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.293303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  31.78 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1027  TrkA domain-containing protein  39.18 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0780  TrkA domain-containing protein  39.18 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 		 620 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1089  TrkA domain-containing protein  39.18 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0695  TrkA domain protein  31.93 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0532772  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0979  TrkA domain-containing protein  37.23 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  26.34 
 
 		 630 aa  71.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  25.12 
 
 		 628 aa  70.5  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0088  TrkA domain-containing protein  32.98 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0708937  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1437  TrkA domain-containing protein  32.98 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000424867  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  28.5 
 
 		 617 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  27.8 
 
 		 626 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  28.38 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  27.35 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  26.44 
 
 		 221 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  25.89 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1019  TrkA-C  33.68 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.602409  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  25.96 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  25.11 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  29.81 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  26.69 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  24.59 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  25.47 
 
 		 617 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  26.9 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  24.43 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1075  TrkA domain-containing protein  23.08 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.913457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  24.49 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  24.77 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  27.16 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  29.6 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  25.76 
 
 		 457 aa  57  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  24.07 
 
 		 443 aa  57  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  27.19 
 
 		 225 aa  56.6  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  26.13 
 
 		 217 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3473  TrkA-N domain protein  22.41 
 
 		 442 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  24.89 
 
 		 219 aa  56.6  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  25.99 
 
 		 221 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  25.42 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  26.58 
 
 		 445 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 		 236 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1266  TrkA-C domain protein  34.74 
 
 		 470 aa  54.7  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  22.22 
 
 		 444 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  25.22 
 
 		 218 aa  54.3  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  24.05 
 
 		 467 aa  53.9  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.52 
 
 		 221 aa  53.5  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  24.76 
 
 		 449 aa  53.5  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  23.97 
 
 		 458 aa  53.5  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  24.34 
 
 		 332 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  27.11 
 
 		 248 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  23.53 
 
 		 222 aa  52.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  23.87 
 
 		 458 aa  52  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  25.35 
 
 		 221 aa  52  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  23.87 
 
 		 458 aa  51.6  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  23.98 
 
 		 693 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  25.48 
 
 		 458 aa  51.6  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  22.13 
 
 		 346 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  24.78 
 
 		 233 aa  50.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  26.34 
 
 		 458 aa  50.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  24.34 
 
 		 218 aa  50.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  24.34 
 
 		 450 aa  50.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  21.96 
 
 		 445 aa  50.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  27.39 
 
 		 224 aa  50.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  25.1 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.06 
 
 		 221 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3673  TrkA-N domain protein  23.35 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728396  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  26.32 
 
 		 231 aa  50.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  23.42 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  24.89 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  24.77 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1198  TrkA domain-containing protein  24.64 
 
 		 214 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  24.77 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  24.77 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  27.73 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  24.67 
 
 		 221 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  24.77 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  24.39 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  25.55 
 
 		 219 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  22.12 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  23.41 
 
 		 469 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  24.77 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  24.35 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  24.66 
 
 		 225 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  25.21 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  24.88 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  24.52 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  20.96 
 
 		 219 aa  49.3  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  32.65 
 
 		 214 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  25.32 
 
 		 457 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  24.38 
 
 		 336 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  29.07 
 
 		 511 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  23.83 
 
 		 220 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  26.32 
 
 		 253 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  29.66 
 
 		 141 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  21.19 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  26 
 
 		 215 aa  48.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.06 
 
 		 221 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>