195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1796 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1796  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 471 aa  951    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.293303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0177  K+ transport systems, NAD-binding component  25 
 
 		 508 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000132187  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.73 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  30.5 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  29.72 
 
 		 630 aa  71.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  28 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  27.36 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.57 
 
 		 221 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  25.82 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  26.75 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 		 221 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  28.9 
 
 		 458 aa  66.6  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  22.71 
 
 		 218 aa  66.6  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  26.27 
 
 		 458 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  25.24 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  25.88 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.66 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  28.44 
 
 		 628 aa  64.7  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  27.39 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  27.39 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  23.96 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  26.06 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  27.19 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  27.88 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  25.86 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  25.74 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  25.86 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  24.59 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  27.16 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  26.7 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  24.64 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  27.18 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  24.79 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  28.32 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  27.73 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  39.76 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  39.76 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  39.76 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  39.76 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  26.56 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  25.65 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  25 
 
 		 458 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 		 620 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  36.36 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10580  TrkA-N domain protein  24.51 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  24.64 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  24.64 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0088  TrkA domain-containing protein  25.68 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0708937  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  26.87 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  24.64 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  24.64 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  24.56 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  23.7 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  24.17 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  25.24 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  24.12 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  36.14 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  27.19 
 
 		 218 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  28.25 
 
 		 219 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  24.23 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  26.43 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  26.2 
 
 		 229 aa  57  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  26.75 
 
 		 457 aa  57  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  34.09 
 
 		 469 aa  57  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  26.37 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  28.44 
 
 		 248 aa  57  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  43.9 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  27.4 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  27.4 
 
 		 218 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  27.4 
 
 		 457 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  22.03 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  27.47 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  40.24 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  30.68 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  24.68 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 		 617 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  24.2 
 
 		 449 aa  54.7  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  39.02 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  36.59 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  36.59 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  36.59 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  36.59 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  36.59 
 
 		 458 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  36.59 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  36.59 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  36.59 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  36.59 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  36.59 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  36.59 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  36.59 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  36.59 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  36.59 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  29.03 
 
 		 467 aa  53.5  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  25.12 
 
 		 221 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  29.27 
 
 		 214 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  23.67 
 
 		 219 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>