220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_10580 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_10580  TrkA-N domain protein  100 
 
 
447 aa  883    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  26.79 
 
 
450 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  25.11 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  27.84 
 
 
445 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  24.94 
 
 
445 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  24.84 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  24.55 
 
 
444 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  22.35 
 
 
443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  26.22 
 
 
449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  22.56 
 
 
458 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  23.18 
 
 
454 aa  125  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  24.22 
 
 
457 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  25.11 
 
 
457 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  24.26 
 
 
449 aa  124  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  23.62 
 
 
454 aa  123  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  24.22 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  25 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  24.22 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  22.97 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  23.95 
 
 
458 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  24.22 
 
 
457 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  23.18 
 
 
454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  24.02 
 
 
448 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  25.46 
 
 
452 aa  120  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  23.35 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  24.24 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  24.11 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  21.35 
 
 
458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  23.88 
 
 
457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  22.94 
 
 
449 aa  113  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  23.32 
 
 
457 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  22.75 
 
 
450 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  23.28 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  21.09 
 
 
458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  21.09 
 
 
458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  22.28 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  24.16 
 
 
445 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0819  potassium transporter peripheral membrane component  23.78 
 
 
437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  23.73 
 
 
457 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  23.92 
 
 
448 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  24.12 
 
 
459 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  22.22 
 
 
454 aa  109  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  22.75 
 
 
457 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  24.4 
 
 
477 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  24.17 
 
 
458 aa  106  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  23.48 
 
 
457 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  21.67 
 
 
469 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  20.67 
 
 
458 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  20.74 
 
 
469 aa  104  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  21.25 
 
 
469 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  23.09 
 
 
457 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  20.52 
 
 
469 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  20.52 
 
 
469 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  20.52 
 
 
469 aa  103  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  23.27 
 
 
465 aa  103  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  21.1 
 
 
469 aa  103  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  28.99 
 
 
465 aa  103  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  20.52 
 
 
469 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  20.52 
 
 
469 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  23.57 
 
 
458 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  22.08 
 
 
467 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  22.83 
 
 
458 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  20.52 
 
 
469 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  20.52 
 
 
469 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  20.52 
 
 
469 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  22.78 
 
 
458 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  22.76 
 
 
458 aa  101  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  22.81 
 
 
458 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  21.4 
 
 
457 aa  100  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  20.74 
 
 
469 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  22.78 
 
 
458 aa  100  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  23.12 
 
 
458 aa  100  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1358  potassium transporter peripheral membrane component  22.02 
 
 
458 aa  100  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  21.63 
 
 
469 aa  99.8  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  21.17 
 
 
444 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  23.28 
 
 
457 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  20.96 
 
 
469 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  23.38 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  22.04 
 
 
458 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  22.71 
 
 
458 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  23.89 
 
 
485 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  22.71 
 
 
458 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  22.71 
 
 
458 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  22.71 
 
 
458 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  20.77 
 
 
444 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  22.75 
 
 
458 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  22.71 
 
 
458 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  21.7 
 
 
465 aa  98.2  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  23.74 
 
 
458 aa  98.2  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  23.74 
 
 
458 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  23.74 
 
 
458 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  22.25 
 
 
458 aa  97.4  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  23.42 
 
 
452 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  20.52 
 
 
469 aa  97.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4070  potassium transporter peripheral membrane component  19.87 
 
 
471 aa  96.7  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000101925 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  21.51 
 
 
457 aa  96.7  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3912  potassium transporter peripheral membrane component  22.51 
 
 
484 aa  96.7  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  22.51 
 
 
484 aa  96.7  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  22.5 
 
 
458 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  22.5 
 
 
458 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>