12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1019 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1019  TrkA-C  100 
 
 		 468 aa  937    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.602409  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1266  TrkA-C domain protein  40.64 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0088  TrkA domain-containing protein  38.57 
 
 		 472 aa  336  5e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0708937  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1437  TrkA domain-containing protein  37.89 
 
 		 474 aa  336  5.999999999999999e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000424867  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0979  TrkA domain-containing protein  36.44 
 
 		 475 aa  324  2e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1075  TrkA domain-containing protein  33.68 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.913457  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0695  TrkA domain protein  33.12 
 
 		 468 aa  268  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0532772  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1089  TrkA domain-containing protein  31.86 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1027  TrkA domain-containing protein  31.91 
 
 		 466 aa  264  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0780  TrkA domain-containing protein  31.7 
 
 		 466 aa  262  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0177  K+ transport systems, NAD-binding component  33.68 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000132187  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1796  TrkA-N domain protein  22.95 
 
 		 471 aa  50.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.293303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>