More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1702 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1702  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  298  2e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00215418 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0610  thioredoxin domain-containing protein  75.18 
 
 		 140 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000188847 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1573  thioredoxin domain-containing protein  70.92 
 
 		 147 aa  221  2e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366383 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1511  thioredoxin domain-containing protein  65.96 
 
 		 140 aa  203  5e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00655361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  34.12 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  29.7 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  29.7 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  28.42 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  33.68 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  25.77 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1859  thioredoxin  32.22 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.263827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0815  thioredoxin-related  31.91 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221245  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  32.98 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  31.58 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  29.89 
 
 		 241 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  29.79 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  29.79 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  33.73 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  31.17 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  27.72 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  31.91 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  28.72 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  31.58 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  28.89 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  32.94 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  36.99 
 
 		 324 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  26.53 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  26.32 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  29.13 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  35.62 
 
 		 329 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  27.71 
 
 		 324 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  29.76 
 
 		 302 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  27.71 
 
 		 324 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  30.34 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  28.57 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0227  thioredoxin-related  28.57 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  29.29 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  24.79 
 
 		 301 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  30.43 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  28.92 
 
 		 334 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  28.4 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  29.76 
 
 		 302 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  24.74 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  26.8 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  27.71 
 
 		 330 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1614  thioredoxin  27.97 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  27.38 
 
 		 317 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  30.85 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  30.49 
 
 		 302 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  29.63 
 
 		 287 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  21.95 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 		 427 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  23.14 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  30.56 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  30.56 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  30.56 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  24.75 
 
 		 282 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  27.66 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  24.75 
 
 		 282 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  25.51 
 
 		 341 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  29.63 
 
 		 302 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  28.87 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  27.59 
 
 		 289 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  31.33 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  33.78 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  25.47 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  27.38 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  25.41 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  25.41 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  25.41 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  28.74 
 
 		 460 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  29.79 
 
 		 120 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  25.41 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  25.41 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  24.75 
 
 		 282 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  25.41 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  24.75 
 
 		 282 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  27.55 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  25.41 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  25.41 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  25.41 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  25.25 
 
 		 287 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0062  thioredoxin  25 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  25.23 
 
 		 282 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  29.17 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  29.27 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  25.23 
 
 		 282 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  23.76 
 
 		 302 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  29.76 
 
 		 307 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  26.23 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  26.04 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  29.79 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  25.74 
 
 		 918 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  26.23 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  26.21 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  26.23 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  31.33 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  35.9 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  26.23 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  26.23 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>