More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0610 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0610  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  295  2e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000188847 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1702  thioredoxin domain-containing protein  75.18 
 
 		 142 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00215418 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1511  thioredoxin domain-containing protein  67.86 
 
 		 140 aa  218  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00655361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1573  thioredoxin domain-containing protein  65.25 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  34.69 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  34.69 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  27.84 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  25.37 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  32.18 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  25.41 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  29.25 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1614  thioredoxin  29.06 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  31.58 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  26.73 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  26.73 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  24.11 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  30 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1859  thioredoxin  32.56 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.263827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  35.23 
 
 		 329 aa  53.9  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  35.23 
 
 		 324 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06915  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13640)  31.03 
 
 		 585 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.727522 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  26.42 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  30.43 
 
 		 324 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  27.72 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  30.43 
 
 		 324 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  27.72 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  32.14 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  27.72 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  25.49 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  29.47 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  30.56 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  29.76 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  30.56 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  24.76 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0815  thioredoxin-related  29.89 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221245  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  30.68 
 
 		 302 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  28.07 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  26.21 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  25.56 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  27.45 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0788  thioredoxin  30.34 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  30.85 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  35.14 
 
 		 108 aa  50.8  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  30.68 
 
 		 302 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  27.27 
 
 		 317 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  30.95 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  26.6 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  31.25 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  26.87 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  29.17 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  24.51 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  26.09 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  27.84 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  25.49 
 
 		 110 aa  50.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  30 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  29.07 
 
 		 330 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  24.75 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  24.75 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  23.76 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  27.06 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  29.47 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0062  thioredoxin  26.13 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  23.16 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  24.47 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  29.17 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  22.77 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  28.43 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  27.45 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  29.79 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  29.79 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  22.77 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  24.51 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  26.47 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  33.72 
 
 		 334 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  22.77 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  27.72 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  26.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  26.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  26.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  26.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  26.47 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  26.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  28.95 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  26.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  25.49 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  29.47 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  28.24 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  26.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  26.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0227  thioredoxin-related  29.89 
 
 		 130 aa  48.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  26.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  25.88 
 
 		 268 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  26.92 
 
 		 113 aa  48.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  26.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  26.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  25.49 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  26.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  26.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0885  Thioredoxin domain protein  31 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>