More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1573 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1573  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  303  6e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366383 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1702  thioredoxin domain-containing protein  70.92 
 
 		 142 aa  221  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00215418 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0610  thioredoxin domain-containing protein  65.25 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000188847 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1511  thioredoxin domain-containing protein  68.79 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00655361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  36.47 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  32.35 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  30.39 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  30.69 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  28 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1859  thioredoxin  34.83 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.263827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  32.67 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  32.32 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  33.77 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  29.7 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  32.14 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1614  thioredoxin  26.5 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  26.47 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  32.89 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  32.89 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  30.3 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  28.28 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  27.73 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  24.62 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  33.33 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  33.33 
 
 		 334 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  28.57 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  27.37 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  33.33 
 
 		 330 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  31.18 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  29.89 
 
 		 547 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  28.72 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  28.72 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  29.76 
 
 		 282 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0227  thioredoxin-related  30.68 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  29.76 
 
 		 282 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  34.62 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  31.33 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  23.53 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  31.52 
 
 		 324 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  31.52 
 
 		 324 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  29.76 
 
 		 282 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  32.95 
 
 		 302 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  32.61 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  29.03 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  26.73 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  28.81 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  29.76 
 
 		 282 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  29.76 
 
 		 282 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  29.76 
 
 		 282 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  29.76 
 
 		 282 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  32.14 
 
 		 306 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0062  thioredoxin  26.67 
 
 		 117 aa  50.8  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  31.11 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  25.49 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  32.56 
 
 		 459 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  35.8 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  26.51 
 
 		 241 aa  50.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  32.53 
 
 		 162 aa  50.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  29.79 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  29.76 
 
 		 280 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  28 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  34.09 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  30.11 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.82 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  31.82 
 
 		 302 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  26.19 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  25.53 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  34.25 
 
 		 324 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  27.27 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  25.27 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  30.86 
 
 		 282 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  24.51 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  30.86 
 
 		 282 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  28.74 
 
 		 460 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  31.11 
 
 		 305 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  32.88 
 
 		 329 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  27.38 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  33.77 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  36.36 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4589  thioredoxin family protein  32.99 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000336383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4426  thioredoxin  32.99 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  24.73 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0189  Thioredoxin domain  34.85 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  27.16 
 
 		 918 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  24.73 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2654  thioredoxin-related protein  30.49 
 
 		 370 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.540425 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4945  thioredoxin family protein  32.99 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  25.53 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  30.53 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  24.73 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4806  thioredoxin family protein  32.99 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.707229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0430  thioredoxin family protein  32.99 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  28.04 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4811  thioredoxin family protein  32.99 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  35.37 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  28.87 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  28.57 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>