More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1721 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1721  cytochrome c, class I  100 
 
 		 204 aa  424  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  34.52 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4809  cytochrome c, class I  38.25 
 
 		 213 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  36.69 
 
 		 359 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  32.97 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  32.24 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  32.6 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  32 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  29.95 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  30.43 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  32.24 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  32.24 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  32.24 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  32.24 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  31.32 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  30.94 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  30.94 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  32.24 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  30.6 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  31.87 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  31.72 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  30.6 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  30.6 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  30.6 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  29.44 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  31.15 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  31.52 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  29.96 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  29.83 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  29.38 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  29.52 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  30.98 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  29.38 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  32.79 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  29.52 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  29.57 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  31.69 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  30.81 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  30.81 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  31.49 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  32.67 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  30.17 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  31.16 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  30.94 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  30.9 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  29.07 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  31.16 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  28.73 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  31.41 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  30.17 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  28.89 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  31.63 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  31.85 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  31.54 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  31.12 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  29.94 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  29.11 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  28.86 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  28.85 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  28.37 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  33.11 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  30.86 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  34.13 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  31.75 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  27.87 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  34.23 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  33.15 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  33.15 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  0.0000000978123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  28.37 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  28.37 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  32.78 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  30.43 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  28.34 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  31.93 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  31.58 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  30.32 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  27.4 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  31.41 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  29.57 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  28.48 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  33.57 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  28.44 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  26.86 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  31.09 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  30.99 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  30.05 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  32.6 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  32.14 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  33.12 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2984  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  26.88 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  33.09 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  33.53 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  32.67 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  26.92 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  30.27 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  32.21 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>