48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0222 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  340  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  94.19 
 
 		 172 aa  320  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  73.46 
 
 		 208 aa  234  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  71.08 
 
 		 207 aa  228  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  55.69 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  53.42 
 
 		 161 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  55.28 
 
 		 161 aa  154  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  53.42 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  53.29 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  53.85 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  53.33 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  49.08 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  47.97 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.86 
 
 		 185 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.14 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.56 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.45 
 
 		 187 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.95 
 
 		 194 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3545  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  50.6 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  46 
 
 		 213 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.84 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.19 
 
 		 204 aa  87.8  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.41 
 
 		 189 aa  87.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.25 
 
 		 196 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.58 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  34.5 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  37.66 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3378  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.84 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.65 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.04 
 
 		 276 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.9 
 
 		 142 aa  47.8  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  32.2 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.74 
 
 		 297 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.96 
 
 		 286 aa  45.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.01 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  42.55 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.62 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.52 
 
 		 406 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  29.52 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  34.19 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.65 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  32.41 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  45.1 
 
 		 293 aa  42  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  25.93 
 
 		 152 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  34.34 
 
 		 413 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  30.84 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>