48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2452 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 
297 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  60.85 
 
 
279 aa  350  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  55.6 
 
 
293 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  54.48 
 
 
276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  51.27 
 
 
286 aa  280  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  50 
 
 
142 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  50.43 
 
 
140 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.2 
 
 
144 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.2 
 
 
156 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  34.17 
 
 
172 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  36.43 
 
 
152 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  30.5 
 
 
145 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.22 
 
 
165 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.2 
 
 
165 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  34.45 
 
 
155 aa  55.8  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1101  hypothetical protein  32.77 
 
 
149 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  33.91 
 
 
413 aa  52.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2669  hypothetical protein  30.97 
 
 
169 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167902  normal  0.321934 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  33.59 
 
 
146 aa  52  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  31.93 
 
 
152 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.66 
 
 
406 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0547  hypothetical protein  33.94 
 
 
146 aa  51.2  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  33.62 
 
 
156 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  32.76 
 
 
194 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  29.66 
 
 
152 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30 
 
 
155 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.58 
 
 
208 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  34.82 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0993  hypothetical protein  28.99 
 
 
153 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1100  hypothetical protein  31.37 
 
 
159 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.430581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  37.74 
 
 
172 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5342  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30 
 
 
143 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0414  hypothetical protein  31.9 
 
 
194 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  32.04 
 
 
147 aa  46.6  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  33.01 
 
 
147 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.85 
 
 
172 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0506  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.32 
 
 
170 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  41.18 
 
 
156 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1335  hypothetical protein  30.17 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0242  hypothetical protein  27.34 
 
 
200 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  26.72 
 
 
154 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  41.18 
 
 
156 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.09 
 
 
185 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10651  hypothetical protein  29.06 
 
 
154 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.999834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1568  hypothetical protein  23.4 
 
 
182 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.07 
 
 
187 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.19 
 
 
204 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>