44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01790 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 172 aa  337  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  94.19 
 
 		 172 aa  320  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  71.26 
 
 		 208 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  70.48 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  54.49 
 
 		 183 aa  164  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  52.8 
 
 		 161 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  54.04 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  52.8 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  52.1 
 
 		 173 aa  154  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  54.44 
 
 		 162 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  51.52 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  48.12 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  50.68 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  49.31 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  46.62 
 
 		 189 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.21 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.69 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.76 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.28 
 
 		 194 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.76 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3545  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  48.85 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.44 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.47 
 
 		 188 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.73 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.93 
 
 		 204 aa  87.8  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  36.69 
 
 		 183 aa  85.5  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.6 
 
 		 196 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.89 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  36.67 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.21 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3378  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.84 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.26 
 
 		 276 aa  51.6  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.18 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  30.51 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.85 
 
 		 297 aa  45.1  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.36 
 
 		 286 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.77 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.57 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  39.58 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  28.85 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.69 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.65 
 
 		 406 aa  42  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  32.48 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.18 
 
 		 293 aa  41.2  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>