39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3545 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3545  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  50.6 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  51.79 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  48.85 
 
 		 172 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  46.67 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  47.98 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  46.06 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  46.47 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  44.38 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  45.21 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  44.58 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.17 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.6 
 
 		 172 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.49 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.14 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.75 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.22 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.14 
 
 		 160 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.56 
 
 		 176 aa  94.4  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.31 
 
 		 203 aa  91.3  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  37.14 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.56 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.88 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.71 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.67 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.18 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  38 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.78 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.5 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3378  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.23 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.74 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.29 
 
 		 297 aa  45.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  29.46 
 
 		 140 aa  44.3  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  32.79 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  26.92 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  31.18 
 
 		 156 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  32.71 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  31.18 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>