34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_03940 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 162 aa  320  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  59.75 
 
 		 172 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  59.38 
 
 		 166 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  65.52 
 
 		 183 aa  176  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  58.24 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  61.15 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  61.87 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  59.71 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  54.44 
 
 		 172 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  53.85 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  53.29 
 
 		 207 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  53.99 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  45.18 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.24 
 
 		 176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  49.32 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.62 
 
 		 194 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  49.32 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  46.85 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3545  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  51.79 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  46 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.06 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.89 
 
 		 203 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.95 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.28 
 
 		 189 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.13 
 
 		 204 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  39.86 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.9 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.62 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  35.62 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3378  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.37 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.25 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  26.35 
 
 		 146 aa  44.3  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.52 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>