29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3164 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  92.12 
 
 		 165 aa  310  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  52.67 
 
 		 152 aa  158  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  30.3 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  30.3 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  28.57 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  30.37 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  30.37 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10651  hypothetical protein  25.37 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.999834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.22 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.68 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  34.4 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  31.3 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  32.06 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.25 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.15 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.33 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  34.17 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.29 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  28.19 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  32.5 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.61 
 
 		 293 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.04 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.68 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.52 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  42.19 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30 
 
 		 185 aa  41.2  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.03 
 
 		 208 aa  40.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>