41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2470 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 
279 aa  564  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  60.85 
 
 
297 aa  350  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  59.79 
 
 
293 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  55.88 
 
 
276 aa  306  3e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  53.26 
 
 
286 aa  295  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  45.59 
 
 
142 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  46.09 
 
 
140 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.44 
 
 
144 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.53 
 
 
156 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  36.67 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  39.25 
 
 
145 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  37.27 
 
 
156 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.33 
 
 
165 aa  55.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.26 
 
 
185 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0547  hypothetical protein  29.81 
 
 
146 aa  50.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.31 
 
 
165 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1101  hypothetical protein  36.29 
 
 
149 aa  48.9  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1568  hypothetical protein  30.83 
 
 
182 aa  48.9  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  27.27 
 
 
146 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  28.81 
 
 
152 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0242  hypothetical protein  24.83 
 
 
200 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.06 
 
 
161 aa  45.8  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0101154  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2669  hypothetical protein  27.34 
 
 
169 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167902  normal  0.321934 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0433  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase superfamily protein  26.06 
 
 
182 aa  45.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485819  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.47 
 
 
142 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  33.05 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  33.94 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.67 
 
 
406 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  35.05 
 
 
161 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.03 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  31.4 
 
 
155 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  27.12 
 
 
152 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0414  hypothetical protein  31.9 
 
 
194 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  31.48 
 
 
413 aa  43.5  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7201  hypothetical protein  31.03 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  26.52 
 
 
147 aa  43.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.3 
 
 
160 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0993  hypothetical protein  23.91 
 
 
153 aa  42.7  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1100  hypothetical protein  47.06 
 
 
159 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.430581 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  26.27 
 
 
154 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>