30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1095 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1095  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0650628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3164  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  92.12 
 
 		 165 aa  310  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1566  hypothetical protein  52.03 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10671  hypothetical protein  30.3 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.134437  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  29.55 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  28.79 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07551  hypothetical protein  29.63 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.113858  normal  0.0161403 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0124  hypothetical protein  29.63 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.221822  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.2 
 
 		 297 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10651  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.999834  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14861  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.15 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0740611 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  30.88 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.83 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  31.3 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  28.86 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  35.2 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.67 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.19 
 
 		 276 aa  52.4  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.5 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.29 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.31 
 
 		 279 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.33 
 
 		 293 aa  48.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.62 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  43.75 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.68 
 
 		 204 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2835  hypothetical protein  30.89 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.19 
 
 		 208 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  31.62 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.77 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.67 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>