39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3293 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 406 aa  830    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2515  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  42.36 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.991601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0336  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.48 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4043  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.94 
 
 		 394 aa  252  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  37.07 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4040  hypothetical protein  33 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2512  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.68 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731479 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0203  hypothetical protein  32.94 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0333  hypothetical protein  40.38 
 
 		 387 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616988 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3641  pfkB family carbohydrate kinase  29.39 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0433  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase superfamily protein  31.21 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  35.96 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.46 
 
 		 142 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.14 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  36.36 
 
 		 147 aa  55.8  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36 
 
 		 293 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1600  PfkB family carbohydrate kinase  26.78 
 
 		 445 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.744108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  29.32 
 
 		 156 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.66 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.56 
 
 		 142 aa  50.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3480  hypothetical protein  28.26 
 
 		 156 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.332353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  34.35 
 
 		 207 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.38 
 
 		 208 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  31.3 
 
 		 146 aa  47  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  38.16 
 
 		 322 aa  47  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.67 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  30.47 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  30 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1150  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.28 
 
 		 286 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.404491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0225  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.73 
 
 		 276 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  30.71 
 
 		 269 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  36.52 
 
 		 172 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 319 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  34.34 
 
 		 147 aa  43.5  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  30.56 
 
 		 156 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  30.28 
 
 		 155 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.19 
 
 		 194 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3647  xylose isomerase domain-containing protein  37.68 
 
 		 292 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0212849 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0017  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.53 
 
 		 143 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.520531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>